RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326181.10

TRAF7-201, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF7, Length 3,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-201ENST00000326181 FEM1BQ9UK73 627 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 FDX1P10109 184 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 NCKAP1LP55160 1127 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CAV1Q03135 178 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 RIPK1Q13546 671 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 A0A1W2PPM1 405 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 WDR64B1ANS9 1081 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MTERF2Q49AM1 385 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF516Q92618 1163 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 NPHS2Q9NP85 383 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SIPA1L1O43166 1804 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MYPNQ86TC9 1320 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CRYMQ14894 314 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 LRRD1A4D1F6 860 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 UNC5CO95185 931 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ICAM1P05362 532 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SLC1A1P43005 524 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 WNT7BP56706 349 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SPARCL1Q14515 664 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 NLRX1Q86UT6 975 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 YDJCA8MPS7 323 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CCNG2Q16589 344 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SLCO2A1Q92959 643 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 GCKP35557 465 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CENPCQ03188 943 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MAMLD1Q13495 774 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 32.1
TRAF7-201ENST00000326181 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 BBOF1Q8ND07 529 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 EPHB2P29323 1055 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ALDH3A1P30838 453 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ERFP50548 548 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SLC1A5Q15758 541 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 LONP2Q86WA8 852 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM143Q96AN5 459 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MCEEQ96PE7 176 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MRIQ9BWK5 157 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CHKBQ9Y259 395 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SCN9AQ15858 1988 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 F8VP50 259 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 MAPK13O15264 365 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PDHA1P08559 390 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 SPDYE6P0CI01 402 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 KRT4P19013 534 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 HSD17B4P51659 736 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 GAD2Q05329 585 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 PGM5Q15124 567 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 C4orf19Q8IY42 314 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 FAM81BQ96LP2 452 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF536O15090 1300 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF7-201ENST00000326181 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms