RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 BGNP21810 368 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PTGIRP43119 386 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SV2AQ7L0J3 742 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 RASSF3Q86WH2 238 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 COA1Q9GZY4 146 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 VCX3BQ9H321 246 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 NDE1Q9NXR1 346 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 GABBR1Q9UBS5 961 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 DISP2A7MBM2 1401 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 O00370 1275 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PAEPP09466 180 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MYL2P10916 166 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PDE1BQ01064 536 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MCF2LO15068 1137 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 C21orf2O43822 256 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ETS2P15036 469 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TAC1P20366 129 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SREBF1P36956 1147 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 VHLP40337 213 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 LGSNQ5TDP6 509 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 VSTM1Q6UX27 236 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA24Q86W54 205 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 THNSL1Q8IYQ7 743 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TBX3O15119 743 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 CST8O60676 142 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 APOL6Q9BWW8 343 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 KAT6AQ92794 2004 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PSEN1P49768 467 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 DLGAP5Q15398 846 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 GRAP2O75791 330 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 DESP17661 470 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 PEX5P50542 639 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 CACNA2D1P54289 1103 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM143Q96AN5 459 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TRIM11Q96F44 468 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 NSL1Q96IY1 281 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 WDR18Q9BV38 432 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 WEE2P0C1S8 567 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 JAM2P57087 298 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 FMO1Q01740 532 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 TMED1Q13445 227 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 SLC1A5Q15758 541 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 RSPH3Q86UC2 560 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MORC4Q8TE76 937 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 RMDN3Q96TC7 470 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-201ENST00000295718 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms