RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF12Q96FN5 646 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CASD1Q96PB1 797 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HCSTQ9UBK5 93 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKR1B10O60218 316 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRN2O75325 713 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DGKIO75912 1065 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL18RAPO95256 599 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARID5AQ03989 594 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABI1Q8IZP0 508 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NT5C1BQ96P26 610 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BIRC3Q13489 604 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPR88Q9GZN0 384 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASB7Q9H672 318 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRSQ13332 1948 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 B4GALT3O60512 393 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-DRAP01903 254 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC172P0C7W6 258 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANXA13P27216 316 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPA17Q15506 151 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM81BQ96LP2 452 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GFPT2O94808 682 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJB5O95377 273 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNE1P15382 129 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIK3CAP42336 1068 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD302Q8IX05 232 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RABGGTAQ92696 567 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INPPL1O15357 1258 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXA2O43364 376 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VNN1O95497 513 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THP07101 528 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RABGGTBP53611 331 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MFAP3P55082 362 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAB2Q15742 525 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB6Q15916 424 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC9A7Q96T83 725 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YME1L1Q96TA2 773 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF263O14978 683 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDHD2O94830 711 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR44Q5JSH3 913 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1328Q86T90 577 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 URGCPQ8TCY9 931 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2CD2Q9Y426 696 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL4A6Q14031 1691 aa21.83■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP25P42331 645 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAV2P52735 878 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP27A1Q02318 531 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCNT1Q02742 428 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTK2Q05397 1052 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0U1RQJ8 604 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHACTR2O75167 634 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIK3Q13003 919 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms