RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 RELL1Q8IUW5 271 aa18.41■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 PASD1Q8IV76 773 aa18.41■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.41■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 PARVAQ9NVD7 372 aa18.41■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 MMP8P22894 467 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 GRM1Q13255 1194 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 CAPSQ13938 189 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 CNGA2Q16280 664 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 POTEAQ6S8J7 498 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 PIGWQ7Z7B1 504 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 BBOF1Q8ND07 529 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 HEMGNQ9BXL5 484 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 SIP14410 1827 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 THAP12O43422 761 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 FAM189A1O60320 539 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 ACSL3O95573 720 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 ADCY8P40145 1251 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC89Q8N998 374 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF606Q8WXB4 792 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 SCLT1Q96NL6 688 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.4■□□□□ 0.54
CLDN11-201ENST00000064724 ASS1P00966 412 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 EDNRBP24530 442 aa18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LONRF1Q17RB8 773 aa18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CCT6BQ92526 530 aa18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC114Q96M63 670 aa18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LCTP09848 1927 aa18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 H0YHG0 523 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 EFNA5P52803 228 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 WDR49Q8IV35 697 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 PPME1Q9Y570 386 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 KLRC2P26717 231 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ATP5DP30049 168 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CHADLQ6NUI6 762 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LBX2Q6XYB7 198 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF365Q70YC5 407 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.38■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 DNM1LO00429 736 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TOM1L1O75674 476 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LSM8O95777 96 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CST3P01034 146 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 GHRP10912 638 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 STAT5BP51692 787 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ITIH4Q14624 930 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 KYNUQ16719 465 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC38Q5VT99 294 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC34Q8IZ02 419 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 MSCO60682 206 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 TGFB3P10600 412 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CD58P19256 250 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 CETN2P41208 172 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 LMNB2Q03252 620 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 NEDD9Q14511 834 aa18.37■□□□□ 0.53
CLDN11-201ENST00000064724 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms