RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR1D2P34982 312 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NCKAP1LP55160 1127 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPEM2Q0P670 501 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RAB33AQ14088 237 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX12PQ92771 950 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNTG2Q9NY99 539 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GDE1Q9NZC3 331 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP24Q9UPU5 2620 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYMKA6NI61 221 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 K7ENM7 598 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRAK2O60296 914 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 THP07101 528 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NRLP54845 237 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FZD5Q13467 585 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPM1JQ5JR12 505 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NETO1Q8TDF5 533 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPATA32Q96LK8 384 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTGESO14684 152 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RHOP08100 348 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP2R5DQ14738 602 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNASE1L2Q92874 299 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DHX58Q96C10 678 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCHPQ9BT92 498 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GDAQ9Y2T3 454 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHD6Q8TD26 2715 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAN2B1O00754 1011 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC30A4O14863 429 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RECQL4O94761 1208 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NUCB2P80303 420 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RTL10Q7L3V2 364 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IQUBQ8NA54 791 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BICD1Q96G01 975 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDT1Q9H211 546 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHRDQ9H2X0 955 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CUEDC2Q9H467 287 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTRRQ9UBK8 725 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCHHQ07283 1943 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SHISA7A6NL88 538 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TDGF1P13385 188 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IDEP14735 1019 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEBPBP17676 345 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCP2P22307 547 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRM2Q14416 872 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 E2F4Q16254 413 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RESP18Q5W5W9 173 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SFR1Q86XK3 245 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNN1Q92952 543 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNMDQ9H2S6 317 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BRD9Q9H8M2 597 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TBX20Q9UMR3 447 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOTCH4Q99466 2003 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TOM1L1O75674 476 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RETP07949 1114 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FGFR3P22607 806 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PROZP22891 400 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABCD1P33897 745 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZPBP2Q6X784 338 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FIZ1Q96SL8 496 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IER2Q9BTL4 223 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABLIM1O14639 778 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRP3O75074 770 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 B3GAT3O94766 335 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRG1P02750 347 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCF2P10911 925 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GAP43P17677 238 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNA4P22459 653 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms