RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSG2P53898 299 aa4.72□□□□□ -1.65
tW(UCA)QtW(UCA)Q HAL5P38970 855 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLX8P40072 274 aa4.71□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q KRE33P53914 1056 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q HDA3Q06623 655 aa4.71□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-DR3Q12441 440 aa4.71□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDJ1P35191 511 aa4.7□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q SOH1P38633 127 aa4.7□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL066CP43538 392 aa4.7□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q JJJ2P46997 583 aa4.7□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q THI72Q08579 599 aa4.7□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRE1P32361 1115 aa4.69□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALA1P40825 983 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q HGH1P48362 394 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q PKC1P24583 1151 aa4.68□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q BIO2P32451 375 aa4.68□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL034WP43564 1073 aa4.68□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q UTP7P40055 554 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIM21P48565 533 aa4.67□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENO2P00925 437 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q FPS1P23900 669 aa4.66□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR053CQ6Q5F3 151 aa4.66□□□□□ -1.66
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCM1P11746 286 aa4.65□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCT8P47079 568 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL108CP53929 270 aa4.65□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPQ2Q06328 317 aa4.65□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data4.65□□□□□ -1.67not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPM1P00950 247 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM9P40053 627 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWI5P08153 709 aa4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDC6P26263 563 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET1P36150 593 aa4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHM1P37292 490 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL16P38064 232 aa4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCX1P38323 520 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q SKN7P38889 622 aa4.63□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q KNS1P32350 737 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR187CQ03236 431 aa4.62□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q PSH1Q12161 406 aa4.62□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q LEU1P07264 779 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q RDS2P19541 446 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPR3P41901 512 aa4.61□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJL007CP47080 104 aa4.61□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRX10Q05648 414 aa4.61□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q TDA6Q06466 467 aa4.61□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS31P05759 152 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q YTA6P40328 754 aa4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNR014WP53719 212 aa4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q STB3Q12427 513 aa4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q TSC13Q99190 310 aa4.6□□□□□ -1.67
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDC5P16467 563 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q NTH2P35172 780 aa4.58□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q BOI2P39969 1040 aa4.58□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL34BP40525 121 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q SBE2P42223 864 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q RGP1P16664 663 aa4.57□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIS2P36024 562 aa4.57□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q BIM1P40013 344 aa4.57□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q UTP4Q06679 776 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIF1P10081 395 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEP12P32854 288 aa4.56□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q HEH2Q03281 663 aa4.56□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENO1P00924 437 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q SBP1P10080 294 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTG2P32608 588 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALD2P47771 506 aa4.55□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q CYT1P07143 309 aa4.54□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDI1P17967 522 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBP1P25037 809 aa4.54□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG32P40458 529 aa4.54□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q HAP4P14064 554 aa4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCK2P23292 546 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCD5P34758 872 aa4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSC7P38694 644 aa4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q SKP1P52286 194 aa4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data4.53□□□□□ -1.68not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAS4Q08271 471 aa4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR215CQ12240 137 aa4.53□□□□□ -1.68
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO87P25360 923 aa4.52□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q MLF3P32047 452 aa4.52□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL165WP53891 406 aa4.52□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q Q0182Q9ZZW1 134 aa4.52□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAT1P38085 619 aa4.5□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q NCL1P38205 684 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACS2P52910 683 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q NHA1Q99271 985 aa4.5□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q NGR1P32831 672 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q AMN1P38285 549 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPS3P38426 1054 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q KAP122P32767 1081 aa4.48□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q LEO1P38439 464 aa4.48□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q LSB6P42951 607 aa4.48□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTO1P53070 669 aa4.48□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT5P38695 592 aa4.47□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q APM2P38700 605 aa4.47□□□□□ -1.69
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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