RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YMR31	YFR049W	YJR107W	P47145	328 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YMR31	YFR049W	BNI4	P53858	892 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YMR31	YFR049W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YMR31	YFR049W	YDR344C	Q05510	147 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YMR31	YFR049W	LSO1	Q3E827	93 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YMR31	YFR049W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SUV3	P32580	737 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	PEP7	P32609	515 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	ISC10	P32645	267 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SPT23	P35210	1082 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SPR3	P41901	512 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	APP1	P53933	587 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SWI5	P08153	709 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	MCM2	P29469	868 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	YBR197C	P38306	217 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	VAC8	P39968	578 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	FYV10	P40492	516 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	CST6	P40535	587 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	MAD1	P40957	749 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	MNL2	Q12205	849 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	YPR015C	Q12531	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	UBP1	P25037	809 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	TPD3	P31383	635 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	UTR2	P32623	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SPR28	Q04921	423 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	TBS1	P38114	1094 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	GPI13	Q07830	1017 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	GYP1	Q08484	637 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	RPB10	P22139	70 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	ALD3	P54114	506 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	UFD2	P54860	961 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	PUS5	Q06244	254 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	BDS1	Q08347	646 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	MOD5	P07884	428 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	PPG1	P32838	368 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	MKS1	P34072	584 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	SPC42	P36094	363 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	DAK2	P43550	591 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	CWC24	P53769	259 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	ISU1	Q03020	165 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	CAB1	Q04430	367 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YMR31	YFR049W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	RNH70	P53331	553 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	YAF9	P53930	226 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	OXR1	Q08952	273 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	CLN2	P20438	545 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	FBP26	P32604	452 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	SAM37	P50110	327 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	YNL011C	P53980	444 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	VPS16	Q03308	798 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	VPS35	P34110	944 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	DOS2	P54858	310 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	SAS4	Q04003	481 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	DFG5	Q05031	458 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	PIN2	Q12057	282 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	APC11	Q12157	165 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	WTM2	Q12206	467 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	MRPL33	P20084	86 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	SMC1	P32908	1225 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	PET112	P33893	541 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	HXT8	P40886	569 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	OSW7	P43611	510 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	CDC55	Q00362	526 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	RMD1	Q03441	430 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	VMA3	P25515	160 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	PRE3	P38624	215 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	HXT5	P38695	592 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	RTT106	P40161	455 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YMR31	YFR049W	FKH1	P40466	484 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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