RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-215ENST00000635899 APLP2Q06481 763 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 PPLO60437 1756 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 CLTCL1P53675 1640 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 TRPM2O94759 1503 aa7.03□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
CREBBP-215ENST00000635899 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.02□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 IFT172Q9UG01 1749 aa7.02□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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CREBBP-215ENST00000635899 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.02□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 ZFYVE9O95405 1425 aa7.01□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 LTKP29376 864 aa7.01□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 EID1Q9Y6B2 187 aa7.01□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7□□□□□ -1.29
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CREBBP-215ENST00000635899 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.99□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 TMEM94Q12767 1356 aa6.99□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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CREBBP-215ENST00000635899 MSH6P52701 1360 aa6.97□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.97□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.97□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CREBBP-215ENST00000635899 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.96□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 IDI1Q13907 227 aa6.96□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.96□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 ROCK1Q13464 1354 aa6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 LRP6O75581 1613 aa6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 LAMC1P11047 1609 aa6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 BCANQ96GW7 911 aa6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.95□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 ABCA3Q99758 1704 aa6.94□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 KCNA6P17658 529 aa6.93□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.93□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.92□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 DCCP43146 1447 aa6.92□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 PTPRUQ92729 1446 aa6.92□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.91□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 NUP155O75694 1391 aa6.91□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 PIK3R4Q99570 1358 aa6.91□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 JCADQ9P266 1359 aa6.91□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.91□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.91□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 KIF1AQ12756 1690 aa6.9□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.9□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 ITGAEP38570 1179 aa6.9□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 C14orf37Q86TY3 774 aa6.9□□□□□ -1.3
CREBBP-215ENST00000635899 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CREBBP-215ENST00000635899 MST1RQ04912 1400 aa6.89□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.89□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 ITSN1Q15811 1721 aa6.87□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 NAIPQ13075 1403 aa6.87□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 PTCH1Q13635 1447 aa6.87□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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CREBBP-215ENST00000635899 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.86□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 SLAIN2Q9P270 581 aa6.86□□□□□ -1.31
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CREBBP-215ENST00000635899 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.86□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 HFM1A2PYH4 1435 aa6.85□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 METP08581 1390 aa6.85□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.85□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 ATF3P18847 181 aa6.85□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.85□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 USP32Q8NFA0 1604 aa6.85□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.84□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.84□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.84□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 NRAPQ86VF7 1730 aa6.84□□□□□ -1.31
CREBBP-215ENST00000635899 RGS12O14924 1447 aa6.84□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.83□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 BRINP3Q76B58 766 aa6.83□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.83□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.82□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 TRIM52Q96A61 297 aa6.82□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 ALS2Q96Q42 1657 aa6.81□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CREBBP-215ENST00000635899 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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