RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 ZFYVE9O95405 1425 aa28.25■■■□□ 2.11
CLN3-241ENST00000635861 KCNA6P17658 529 aa28.25■■■□□ 2.11
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CLN3-241ENST00000635861 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CLN3-241ENST00000635861 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.21■■■□□ 2.11
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CLN3-241ENST00000635861 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN3-241ENST00000635861 TMEM94Q12767 1356 aa28.18■■■□□ 2.1
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CLN3-241ENST00000635861 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.16■■■□□ 2.1
CLN3-241ENST00000635861 NUP155O75694 1391 aa28.15■■■□□ 2.1
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CLN3-241ENST00000635861 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
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CLN3-241ENST00000635861 PIK3C2GO75747 1445 aa27.39■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 RGL3Q3MIN7 710 aa27.37■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLN3-241ENST00000635861 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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