RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629113.1

LEMD1-210, Transcript of LEM domain containing 1, human

TSL 4

Gene LEMD1, Length 314 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LEMD1-210	ENST00000629113	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LEMD1-210	ENST00000629113	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
LEMD1-210	ENST00000629113	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.96	■■■■■ 4.47
LEMD1-210	ENST00000629113	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
LEMD1-210	ENST00000629113	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.95	■■■■■ 4.47
LEMD1-210	ENST00000629113	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.95	■■■■■ 4.47
LEMD1-210	ENST00000629113	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
LEMD1-210	ENST00000629113	NUP155	O75694	1391 aa		42.93	■■■■■ 4.46
LEMD1-210	ENST00000629113	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.93	■■■■■ 4.46
LEMD1-210	ENST00000629113	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.92	■■■■■ 4.46
LEMD1-210	ENST00000629113	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
LEMD1-210	ENST00000629113	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
LEMD1-210	ENST00000629113	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
LEMD1-210	ENST00000629113	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LEMD1-210	ENST00000629113	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LEMD1-210	ENST00000629113	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
LEMD1-210	ENST00000629113	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
LEMD1-210	ENST00000629113	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
LEMD1-210	ENST00000629113	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42.73	■■■■■ 4.43
LEMD1-210	ENST00000629113	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
LEMD1-210	ENST00000629113	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LEMD1-210	ENST00000629113	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LEMD1-210	ENST00000629113	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.68	■■■■■ 4.42
LEMD1-210	ENST00000629113	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
LEMD1-210	ENST00000629113	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LEMD1-210	ENST00000629113	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.63	■■■■■ 4.41
LEMD1-210	ENST00000629113	MSH6	P52701	1360 aa		42.62	■■■■■ 4.41
LEMD1-210	ENST00000629113	NAIP	Q13075	1403 aa		42.6	■■■■■ 4.41
LEMD1-210	ENST00000629113	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.54	■■■■■ 4.4
LEMD1-210	ENST00000629113	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.52	■■■■■ 4.4
LEMD1-210	ENST00000629113	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.49	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.45	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	TRPM2	O94759	1503 aa		42.45	■■■■■ 4.39
LEMD1-210	ENST00000629113	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.44	■■■■■ 4.38
LEMD1-210	ENST00000629113	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.43	■■■■■ 4.38
LEMD1-210	ENST00000629113	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LEMD1-210	ENST00000629113	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
LEMD1-210	ENST00000629113	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LEMD1-210	ENST00000629113	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LEMD1-210	ENST00000629113	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LEMD1-210	ENST00000629113	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LEMD1-210	ENST00000629113	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.34	■■■■■ 4.37
LEMD1-210	ENST00000629113	MET	P08581	1390 aa		42.33	■■■■■ 4.37
LEMD1-210	ENST00000629113	KIF1B	O60333	1816 aa		42.32	■■■■■ 4.36
LEMD1-210	ENST00000629113	ATF3	P18847	181 aa		42.3	■■■■■ 4.36
LEMD1-210	ENST00000629113	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.3	■■■■■ 4.36
LEMD1-210	ENST00000629113	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
LEMD1-210	ENST00000629113	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
LEMD1-210	ENST00000629113	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
LEMD1-210	ENST00000629113	FOXD1	Q16676	465 aa		42.21	■■■■■ 4.35
LEMD1-210	ENST00000629113	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.21	■■■■■ 4.35
LEMD1-210	ENST00000629113	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.19	■■■■■ 4.34
LEMD1-210	ENST00000629113	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.15	■■■■■ 4.34
LEMD1-210	ENST00000629113	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
LEMD1-210	ENST00000629113	DCC	P43146	1447 aa		42.1	■■■■■ 4.33
LEMD1-210	ENST00000629113	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
LEMD1-210	ENST00000629113	MST1R	Q04912	1400 aa		42.07	■■■■■ 4.33
LEMD1-210	ENST00000629113	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	LRP6	O75581	1613 aa		42.04	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	PPL	O60437	1756 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.01	■■■■■ 4.32
LEMD1-210	ENST00000629113	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		41.98	■■■■■ 4.31
LEMD1-210	ENST00000629113	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LEMD1-210	ENST00000629113	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
LEMD1-210	ENST00000629113	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LEMD1-210	ENST00000629113	SHPRH	Q149N8	1683 aa		41.96	■■■■■ 4.31
LEMD1-210	ENST00000629113	RGL3	Q3MIN7	710 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	PTCH1	Q13635	1447 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		41.9	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
LEMD1-210	ENST00000629113	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		41.86	■■■■■ 4.29
LEMD1-210	ENST00000629113	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		41.85	■■■■■ 4.29
LEMD1-210	ENST00000629113	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.85	■■■■■ 4.29
LEMD1-210	ENST00000629113	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		41.8	■■■■■ 4.28
LEMD1-210	ENST00000629113	ORAI2	Q96SN7	254 aa		41.79	■■■■■ 4.28
LEMD1-210	ENST00000629113	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
LEMD1-210	ENST00000629113	IFT172	Q9UG01	1749 aa		41.78	■■■■■ 4.28
LEMD1-210	ENST00000629113	STK26	Q9P289	416 aa		41.75	■■■■■ 4.27
LEMD1-210	ENST00000629113	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
LEMD1-210	ENST00000629113	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		41.72	■■■■■ 4.27
LEMD1-210	ENST00000629113	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		41.71	■■■■■ 4.27
LEMD1-210	ENST00000629113	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		41.71	■■■■■ 4.27
LEMD1-210	ENST00000629113	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		41.69	■■■■■ 4.26
LEMD1-210	ENST00000629113	LAMC1	P11047	1609 aa		41.64	■■■■■ 4.26
LEMD1-210	ENST00000629113	AFF2	P51816	1311 aa		41.64	■■■■■ 4.26
LEMD1-210	ENST00000629113	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.26
LEMD1-210	ENST00000629113	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		41.63	■■■■■ 4.25

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