RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC13BO14795 1591 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEAQ6S8J7 498 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MSH6P52701 1360 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PCH4 1651 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SLAIN2Q9P270 581 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-216ENST00000628306 BCANQ96GW7 911 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX22Q9Y458 520 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PHLPP1O60346 1717 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-216ENST00000628306 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-216ENST00000628306 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ROCK1Q13464 1354 aa36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-216ENST00000628306 JCADQ9P266 1359 aa36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-216ENST00000628306 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DIP2AQ14689 1571 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3R4Q99570 1358 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRUQ92729 1446 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP6O75581 1613 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-216ENST00000628306 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP155O75694 1391 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM2O94759 1503 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-216ENST00000628306 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf37Q86TY3 774 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SHPRHQ149N8 1683 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF3P18847 181 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-216ENST00000628306 BRINP3Q76B58 766 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-216ENST00000628306 DCCP43146 1447 aa36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGAEP38570 1179 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-216ENST00000628306 METP08581 1390 aa36.57■■■■□ 3.44
CAPNS1-216ENST00000628306 MST1RQ04912 1400 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-216ENST00000628306 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CLTCL1P53675 1640 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.424e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM52Q96A61 297 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-216ENST00000628306 NAIPQ13075 1403 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-216ENST00000628306 AFF2P51816 1311 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-216ENST00000628306 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-216ENST00000628306 RXRBP28702 533 aa36.32■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF1BO60333 1816 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMC1P11047 1609 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 PTCH1Q13635 1447 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.26■■■■□ 3.39
CAPNS1-216ENST00000628306 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS12O14924 1447 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf37Q96NL8 207 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ORAI2Q96SN7 254 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 HFM1A2PYH4 1435 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PPLO60437 1756 aa36.13■■■■□ 3.38
CAPNS1-216ENST00000628306 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS2O95450 1211 aa36.07■■■■□ 3.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-216ENST00000628306 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NGLY1Q96IV0 654 aa36.02■■■■□ 3.36
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