RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	HFM1	A2PYH4	1435 aa		43.63	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		43.62	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		43.62	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		43.62	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.58	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.57	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		43.57	■■■■■ 4.57
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.56	■■■■■ 4.56
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.53	■■■■■ 4.56
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNA6	P17658	529 aa		43.52	■■■■■ 4.56
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.46	■■■■■ 4.55
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.45	■■■■■ 4.55
SEMA3B-215	ENST00000621029	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.44	■■■■■ 4.54
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSPA1L	P34931	641 aa		43.38	■■■■■ 4.53
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.38	■■■■■ 4.53
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.37	■■■■■ 4.53
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPM2	O94759	1503 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SEMA3B-215	ENST00000621029	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		43.33	■■■■■ 4.53
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALK	Q9UM73	1620 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.29	■■■■■ 4.52
SEMA3B-215	ENST00000621029	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.28	■■■■■ 4.52
SEMA3B-215	ENST00000621029	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.26	■■■■■ 4.52
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.26	■■■■■ 4.52
SEMA3B-215	ENST00000621029	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOXD1	Q16676	465 aa		43.23	■■■■■ 4.51
SEMA3B-215	ENST00000621029	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SEMA3B-215	ENST00000621029	C14orf37	Q86TY3	774 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	MSH6	P52701	1360 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF1B	O60333	1816 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SEMA3B-215	ENST00000621029	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
SEMA3B-215	ENST00000621029	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.06	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SEMA3B-215	ENST00000621029	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SEMA3B-215	ENST00000621029	MET	P08581	1390 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SEMA3B-215	ENST00000621029	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATF3	P18847	181 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SEMA3B-215	ENST00000621029	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SEMA3B-215	ENST00000621029	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SEMA3B-215	ENST00000621029	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SEMA3B-215	ENST00000621029	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
SEMA3B-215	ENST00000621029	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPL	O60437	1756 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SEMA3B-215	ENST00000621029	DCC	P43146	1447 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SEMA3B-215	ENST00000621029	HRC	P23327	699 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SEMA3B-215	ENST00000621029	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SEMA3B-215	ENST00000621029	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK26	Q9P289	416 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SEMA3B-215	ENST00000621029	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	MST1R	Q04912	1400 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.53	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	SOCS7	O14512	581 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
SEMA3B-215	ENST00000621029	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SEMA3B-215	ENST00000621029	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SEMA3B-215	ENST00000621029	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYOM2	P54296	1465 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SEMA3B-215	ENST00000621029	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	TECPR2	O15040	1411 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37

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