RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.62□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.62□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 MAP3K1Q13233 1512 aa12.62□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.61□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 EPAS1Q99814 870 aa12.6□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 LRCH3Q96II8 777 aa12.59□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 LAPTM4AQ15012 233 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.58□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 IFT140Q96RY7 1462 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.57□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 ADAMTS12P58397 1594 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 DPYSL4O14531 572 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 GFRA3O60609 400 aa12.55□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 CAMK2BQ13554 666 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 SAMD9Q5K651 1589 aa12.54□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.4
CTXN3-204ENST00000620385 DDX12PQ92771 950 aa12.52□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 TSKSQ9UJT2 592 aa12.52□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.52□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.5□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 TIAM1Q13009 1591 aa12.5□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 GRIN2BQ13224 1484 aa12.49□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.48□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 PPP4CP60510 307 aa12.47□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 ERCC6Q03468 1493 aa12.46□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 FMN1Q68DA7 1419 aa12.46□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 PACS2Q86VP3 889 aa12.46□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CTXN3-204ENST00000620385 IQGAP2Q13576 1575 aa12.45□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 SAMD7Q7Z3H4 446 aa12.44□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 SMAPO00193 183 aa12.43□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 NBR1Q14596 966 aa12.43□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 MAP3K7O43318 606 aa12.42□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 PPP1R18Q6NYC8 613 aa12.42□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 MTRQ99707 1265 aa12.42□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.42□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 C3orf80F5H4A9 247 aa12.4□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.4□□□□□ -0.42
CTXN3-204ENST00000620385 IL21Q9HBE4 155 aa12.39□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 HECW1Q76N89 1606 aa12.39□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF516Q92618 1163 aa12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.38□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.36□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 PRSS12P56730 875 aa12.35□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.35□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 PDIA6Q15084 440 aa12.34□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 GRIN2AQ12879 1464 aa12.34□□□□□ -0.43
CTXN3-204ENST00000620385 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 SYNJ2O15056 1496 aa12.33□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.32□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.32□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 TATDN2Q93075 761 aa12.32□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA0556O60303 1618 aa12.31□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 APLP1P51693 650 aa12.31□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.31□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.31□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF787Q6DD87 383 aa12.3□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 PNMA3Q9UL41 463 aa12.3□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 NBPF26B4DH59 902 aa12.28□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 RNF40O75150 1001 aa12.28□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.28□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.28□□□□□ -0.44
CTXN3-204ENST00000620385 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.27□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 CERKQ8TCT0 537 aa12.26□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 NUP160Q12769 1436 aa12.25□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.24□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 CEP170Q5SW79 1584 aa12.23□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.23□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.22□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF11O15085 1522 aa12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms