RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619916.4

ACBD4-216, Transcript of acyl-CoA binding domain containing 4, human

TSL 5 BASIC

Gene ACBD4, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACBD4-216	ENST00000619916	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
ACBD4-216	ENST00000619916	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
ACBD4-216	ENST00000619916	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ACBD4-216	ENST00000619916	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	UNC13B	O14795	1591 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.86	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ACBD4-216	ENST00000619916	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
ACBD4-216	ENST00000619916	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.81	■■■■□ 3
ACBD4-216	ENST00000619916	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.8	■■■■□ 3
ACBD4-216	ENST00000619916		E9PCH4	1651 aa		33.8	■■■■□ 3
ACBD4-216	ENST00000619916	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
ACBD4-216	ENST00000619916	MSH6	P52701	1360 aa		33.76	■■■■□ 3
ACBD4-216	ENST00000619916	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ACBD4-216	ENST00000619916	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ACBD4-216	ENST00000619916	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
ACBD4-216	ENST00000619916	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ACBD4-216	ENST00000619916	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.71	■■■□□ 2.99
ACBD4-216	ENST00000619916	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.7	■■■□□ 2.99
ACBD4-216	ENST00000619916	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.68	■■■□□ 2.98
ACBD4-216	ENST00000619916	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
ACBD4-216	ENST00000619916	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
ACBD4-216	ENST00000619916	NUP155	O75694	1391 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ACBD4-216	ENST00000619916	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ACBD4-216	ENST00000619916	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ACBD4-216	ENST00000619916	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ACBD4-216	ENST00000619916	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ACBD4-216	ENST00000619916	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	ITGAE	P38570	1179 aa		33.54	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	TRPM2	O94759	1503 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACBD4-216	ENST00000619916	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.46	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	ATF3	P18847	181 aa		33.45	■■■□□ 2.95
ACBD4-216	ENST00000619916	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
ACBD4-216	ENST00000619916	LRP6	O75581	1613 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ACBD4-216	ENST00000619916	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ACBD4-216	ENST00000619916	DCC	P43146	1447 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ACBD4-216	ENST00000619916	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ACBD4-216	ENST00000619916	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ACBD4-216	ENST00000619916	MET	P08581	1390 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ACBD4-216	ENST00000619916	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ACBD4-216	ENST00000619916	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
ACBD4-216	ENST00000619916	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ACBD4-216	ENST00000619916	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
ACBD4-216	ENST00000619916	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
ACBD4-216	ENST00000619916	MST1R	Q04912	1400 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ACBD4-216	ENST00000619916	NAIP	Q13075	1403 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ACBD4-216	ENST00000619916	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ACBD4-216	ENST00000619916	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
ACBD4-216	ENST00000619916	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
ACBD4-216	ENST00000619916	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ACBD4-216	ENST00000619916	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ACBD4-216	ENST00000619916	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ACBD4-216	ENST00000619916	KIF1B	O60333	1816 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ACBD4-216	ENST00000619916	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ACBD4-216	ENST00000619916	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
ACBD4-216	ENST00000619916	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
ACBD4-216	ENST00000619916	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
ACBD4-216	ENST00000619916	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ACBD4-216	ENST00000619916	RXRB	P28702	533 aa		33.07	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	LAMC1	P11047	1609 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	AFF2	P51816	1311 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	PPL	O60437	1756 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
ACBD4-216	ENST00000619916	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ACBD4-216	ENST00000619916	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
ACBD4-216	ENST00000619916	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ACBD4-216	ENST00000619916	FOXD1	Q16676	465 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ACBD4-216	ENST00000619916	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
ACBD4-216	ENST00000619916	RGS12	O14924	1447 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ACBD4-216	ENST00000619916	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
ACBD4-216	ENST00000619916	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACBD4-216	ENST00000619916	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACBD4-216	ENST00000619916	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACBD4-216	ENST00000619916	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.85	■■■□□ 2.85

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