RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 POTEAQ6S8J7 498 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-217ENST00000613541 SLAIN2Q9P270 581 aa26.64■■□□□ 1.86
STX4-217ENST00000613541 NWD1Q149M9 1564 aa26.63■■□□□ 1.85
STX4-217ENST00000613541 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
STX4-217ENST00000613541 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
STX4-217ENST00000613541 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
STX4-217ENST00000613541 JCADQ9P266 1359 aa26.59■■□□□ 1.85
STX4-217ENST00000613541 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.58■■□□□ 1.85
STX4-217ENST00000613541 ADGRL2O95490 1459 aa26.57■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.56■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 TBX22Q9Y458 520 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 PHLPP1O60346 1717 aa26.55■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 ZFYVE9O95405 1425 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.53■■□□□ 1.84
STX4-217ENST00000613541 C14orf37Q86TY3 774 aa26.51■■□□□ 1.83
STX4-217ENST00000613541 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
STX4-217ENST00000613541 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.48■■□□□ 1.83
STX4-217ENST00000613541 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.48■■□□□ 1.83
STX4-217ENST00000613541 PIK3R4Q99570 1358 aa26.46■■□□□ 1.83
STX4-217ENST00000613541 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
STX4-217ENST00000613541 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.45■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 ATF3P18847 181 aa26.45■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.45■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.45■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.44■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 DIP2AQ14689 1571 aa26.41■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
STX4-217ENST00000613541 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.36■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 UNC13BO14795 1591 aa26.35■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.33■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 TRPM2O94759 1503 aa26.33■■□□□ 1.81
STX4-217ENST00000613541 SHPRHQ149N8 1683 aa26.31■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 LRP6O75581 1613 aa26.31■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 ROCK1Q13464 1354 aa26.31■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 E9PCH4 1651 aa26.3■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 RXRBP28702 533 aa26.29■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 DCCP43146 1447 aa26.29■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 TRIM52Q96A61 297 aa26.28■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 BRINP3Q76B58 766 aa26.27■■□□□ 1.8
STX4-217ENST00000613541 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.26■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 NUP155O75694 1391 aa26.26■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 PTPRUQ92729 1446 aa26.21■■□□□ 1.79
STX4-217ENST00000613541 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.19■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.17■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 AFF2P51816 1311 aa26.16■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.16■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 MST1RQ04912 1400 aa26.14■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
STX4-217ENST00000613541 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.1■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.1■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.09■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 ITGAEP38570 1179 aa26.09■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 METP08581 1390 aa26.08■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.08■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 C8orf37Q96NL8 207 aa26.08■■□□□ 1.77
STX4-217ENST00000613541 NGLY1Q96IV0 654 aa26.05■■□□□ 1.76
STX4-217ENST00000613541 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.05■■□□□ 1.76
STX4-217ENST00000613541 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 FOXD1Q16676 465 aa26■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 RGS12O14924 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 KIF1BO60333 1816 aa25.96■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 ADAMTS2O95450 1211 aa25.96■■□□□ 1.75
STX4-217ENST00000613541 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.95■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 PTCH1Q13635 1447 aa25.95■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 CLTCL1P53675 1640 aa25.93■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 USP21Q9UK80 565 aa25.93■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 LAMC1P11047 1609 aa25.92■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.92■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 ORAI2Q96SN7 254 aa25.89■■□□□ 1.74
STX4-217ENST00000613541 HFM1A2PYH4 1435 aa25.88■■□□□ 1.73
STX4-217ENST00000613541 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
STX4-217ENST00000613541 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.87■■□□□ 1.73
STX4-217ENST00000613541 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.86■■□□□ 1.73
STX4-217ENST00000613541 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.84■■□□□ 1.73
STX4-217ENST00000613541 CCDC125Q86Z20 511 aa25.83■■□□□ 1.73
STX4-217ENST00000613541 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.9 ms