RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, human

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC27A1-208	ENST00000600277	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC27A1-208	ENST00000600277	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SLC27A1-208	ENST00000600277	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLIT1	O75093	1534 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SLC27A1-208	ENST00000600277	LTK	P29376	864 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SLC27A1-208	ENST00000600277	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	BCAN	Q96GW7	911 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	MED14	O60244	1454 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SLC27A1-208	ENST00000600277	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	MYOM2	P54296	1465 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SLC27A1-208	ENST00000600277	PPL	O60437	1756 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SLC27A1-208	ENST00000600277	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SLC27A1-208	ENST00000600277	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SLC27A1-208	ENST00000600277	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SLC27A1-208	ENST00000600277	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SLC27A1-208	ENST00000600277	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SLC27A1-208	ENST00000600277	TBX22	Q9Y458	520 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SLC27A1-208	ENST00000600277	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SLC27A1-208	ENST00000600277	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SLC27A1-208	ENST00000600277	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SLC27A1-208	ENST00000600277	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
SLC27A1-208	ENST00000600277	DIP2A	Q14689	1571 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SLC27A1-208	ENST00000600277	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SLC27A1-208	ENST00000600277	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
SLC27A1-208	ENST00000600277	ALK	Q9UM73	1620 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC27A1-208	ENST00000600277	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SLC27A1-208	ENST00000600277	KCNA6	P17658	529 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SLC27A1-208	ENST00000600277	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	MET	P08581	1390 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	LAMC1	P11047	1609 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	CPS1	P31327	1500 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.45	■■■□□ 2.63
SLC27A1-208	ENST00000600277	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.45	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SLC27A1-208	ENST00000600277	NWD1	Q149M9	1564 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	STK26	Q9P289	416 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	TECPR2	O15040	1411 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SLC27A1-208	ENST00000600277	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	TOM1	O60784	492 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	TMEM94	Q12767	1356 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.26	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.26	■■■□□ 2.6
SLC27A1-208	ENST00000600277	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
SLC27A1-208	ENST00000600277	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SLC27A1-208	ENST00000600277	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SLC27A1-208	ENST00000600277	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SLC27A1-208	ENST00000600277	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SLC27A1-208	ENST00000600277	POGK	Q9P215	609 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SLC27A1-208	ENST00000600277	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SLC27A1-208	ENST00000600277	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SLC27A1-208	ENST00000600277	USP47	Q96K76	1375 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SLC27A1-208	ENST00000600277	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.19	■■■□□ 2.58

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