RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-231ENST00000600201 NWD1Q149M9 1564 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-231ENST00000600201 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-231ENST00000600201 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-231ENST00000600201 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM94Q12767 1356 aa22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 NUP155O75694 1391 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-231ENST00000600201 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.76■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 KCNA6P17658 529 aa22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 SOCS7O14512 581 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 BCANQ96GW7 911 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 CLTCL1P53675 1640 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-231ENST00000600201 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-231ENST00000600201 NAIPQ13075 1403 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-231ENST00000600201 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-231ENST00000600201 DIP2AQ14689 1571 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-231ENST00000600201 PTPRUQ92729 1446 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-231ENST00000600201 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 PHLPP1O60346 1717 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 TRPM2O94759 1503 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 KIF1BO60333 1816 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 TBX22Q9Y458 520 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 MSH6P52701 1360 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-231ENST00000600201 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 HFM1A2PYH4 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-231ENST00000600201 METP08581 1390 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 SLAIN2Q9P270 581 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 PPLO60437 1756 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 PIK3R4Q99570 1358 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 TRIM52Q96A61 297 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 FOXD1Q16676 465 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 C14orf37Q86TY3 774 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-231ENST00000600201 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 LRP6O75581 1613 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 IFT172Q9UG01 1749 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 SHPRHQ149N8 1683 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 POTEAQ6S8J7 498 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 MST1RQ04912 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-231ENST00000600201 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 ATF3P18847 181 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 JCADQ9P266 1359 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 BRINP3Q76B58 766 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 DCCP43146 1447 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-231ENST00000600201 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-231ENST00000600201 PTCH1Q13635 1447 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-231ENST00000600201 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-231ENST00000600201 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 RGL3Q3MIN7 710 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 LAMC1P11047 1609 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-231ENST00000600201 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 ORAI2Q96SN7 254 aa22.19■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 PIK3C2GO75747 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 STK26Q9P289 416 aa22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-231ENST00000600201 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.13■■□□□ 1.13
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