RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.42■■■□□ 2.14
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FCHO1-210ENST00000595594 TMEM94Q12767 1356 aa28.39■■■□□ 2.14
FCHO1-210ENST00000595594 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 KCNA6P17658 529 aa28.37■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.36■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 ZFYVE9O95405 1425 aa28.35■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.35■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 ROCK1Q13464 1354 aa28.35■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 NWD1Q149M9 1564 aa28.34■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
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FCHO1-210ENST00000595594 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
FCHO1-210ENST00000595594 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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FCHO1-210ENST00000595594 NUP155O75694 1391 aa28.29■■■□□ 2.12
FCHO1-210ENST00000595594 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.28■■■□□ 2.12
FCHO1-210ENST00000595594 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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FCHO1-210ENST00000595594 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.2■■■□□ 2.1
FCHO1-210ENST00000595594 MSH6P52701 1360 aa28.19■■■□□ 2.1
FCHO1-210ENST00000595594 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.18■■■□□ 2.1
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FCHO1-210ENST00000595594 TBX22Q9Y458 520 aa28.15■■■□□ 2.1
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FCHO1-210ENST00000595594 C14orf37Q86TY3 774 aa28.12■■■□□ 2.09
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FCHO1-210ENST00000595594 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
FCHO1-210ENST00000595594 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.08■■■□□ 2.09
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FCHO1-210ENST00000595594 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
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FCHO1-210ENST00000595594 PIK3R4Q99570 1358 aa28■■■□□ 2.07
FCHO1-210ENST00000595594 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.99■■■□□ 2.07
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FCHO1-210ENST00000595594 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.97■■■□□ 2.07
FCHO1-210ENST00000595594 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.96■■■□□ 2.07
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FCHO1-210ENST00000595594 METP08581 1390 aa27.95■■■□□ 2.06
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FCHO1-210ENST00000595594 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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FCHO1-210ENST00000595594 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.52■■■□□ 2
FCHO1-210ENST00000595594 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.51■■□□□ 1.99
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