RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593870.5

FCHO1-204, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-204ENST00000593870 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-204ENST00000593870 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-204ENST00000593870 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.54■□□□□ 0.56
FCHO1-204ENST00000593870 UNC13BO14795 1591 aa18.52■□□□□ 0.56
FCHO1-204ENST00000593870 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 NWD1Q149M9 1564 aa18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 EID1Q9Y6B2 187 aa18.51■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 ZFYVE9O95405 1425 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 E9PCH4 1651 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 TMEM94Q12767 1356 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 KCNA6P17658 529 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-204ENST00000593870 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.45■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.44■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.44■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.41■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.4■□□□□ 0.54
FCHO1-204ENST00000593870 TRIM52Q96A61 297 aa18.39■□□□□ 0.53
FCHO1-204ENST00000593870 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-204ENST00000593870 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.37■□□□□ 0.53
FCHO1-204ENST00000593870 NUP155O75694 1391 aa18.33■□□□□ 0.53
FCHO1-204ENST00000593870 TBX22Q9Y458 520 aa18.32■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 DIP2AQ14689 1571 aa18.32■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.31■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 MSH6P52701 1360 aa18.3■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 PHLPP1O60346 1717 aa18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 PTPRUQ92729 1446 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 SLAIN2Q9P270 581 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-204ENST00000593870 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 BCANQ96GW7 911 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 PIK3R4Q99570 1358 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 TRPM2O94759 1503 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 POTEAQ6S8J7 498 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 CLTCL1P53675 1640 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-204ENST00000593870 LRP6O75581 1613 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 JCADQ9P266 1359 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 SHPRHQ149N8 1683 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 TONSLQ96HA7 1378 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 FOXD1Q16676 465 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 METP08581 1390 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 DCCP43146 1447 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-204ENST00000593870 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 NEUROD1Q13562 356 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 KIF1BO60333 1816 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 BRINP3Q76B58 766 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 MST1RQ04912 1400 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 C14orf37Q86TY3 774 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 ATF3P18847 181 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-204ENST00000593870 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-204ENST00000593870 PPLO60437 1756 aa18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-204ENST00000593870 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-204ENST00000593870 LAMC1P11047 1609 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-204ENST00000593870 PTCH1Q13635 1447 aa18.02■□□□□ 0.48
FCHO1-204ENST00000593870 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 C1orf167Q5SNV9 1468 aa17.99■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 IFT172Q9UG01 1749 aa17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 PNPLA6Q8IY17 1366 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
FCHO1-204ENST00000593870 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-204ENST00000593870 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-204ENST00000593870 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms