RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PSME3-216ENST00000593111 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PSME3-216ENST00000593111 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PSME3-216ENST00000593111 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PSME3-216ENST00000593111 MSH6P52701 1360 aa26.96■■□□□ 1.91
PSME3-216ENST00000593111 SLAIN2Q9P270 581 aa26.95■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.95■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.94■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.94■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 ZFYVE9O95405 1425 aa26.92■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 NWD1Q149M9 1564 aa26.92■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.91■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.89■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 C14orf37Q86TY3 774 aa26.89■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 TBX22Q9Y458 520 aa26.89■■□□□ 1.9
PSME3-216ENST00000593111 POTEAQ6S8J7 498 aa26.88■■□□□ 1.89
PSME3-216ENST00000593111 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.87■■□□□ 1.89
PSME3-216ENST00000593111 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PSME3-216ENST00000593111 ITGAEP38570 1179 aa26.85■■□□□ 1.89
PSME3-216ENST00000593111 UNC13BO14795 1591 aa26.84■■□□□ 1.89
PSME3-216ENST00000593111 PHLPP1O60346 1717 aa26.81■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 E9PCH4 1651 aa26.8■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 NUP155O75694 1391 aa26.8■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 ROCK1Q13464 1354 aa26.8■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 JCADQ9P266 1359 aa26.8■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 ATF3P18847 181 aa26.77■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.77■■□□□ 1.88
PSME3-216ENST00000593111 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.76■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.76■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.75■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.74■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.74■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 PIK3R4Q99570 1358 aa26.72■■□□□ 1.87
PSME3-216ENST00000593111 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 DIP2AQ14689 1571 aa26.7■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.66■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 TRPM2O94759 1503 aa26.66■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 PTPRUQ92729 1446 aa26.65■■□□□ 1.86
PSME3-216ENST00000593111 BRINP3Q76B58 766 aa26.62■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 LRP6O75581 1613 aa26.59■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PSME3-216ENST00000593111 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 TRIM52Q96A61 297 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 METP08581 1390 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 DCCP43146 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 SHPRHQ149N8 1683 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME3-216ENST00000593111 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PSME3-216ENST00000593111 RXRBP28702 533 aa26.49■■□□□ 1.83
PSME3-216ENST00000593111 MST1RQ04912 1400 aa26.48■■□□□ 1.83
PSME3-216ENST00000593111 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PSME3-216ENST00000593111 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.48■■□□□ 1.83
PSME3-216ENST00000593111 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PSME3-216ENST00000593111 CLTCL1P53675 1640 aa26.45■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.44■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 AFF2P51816 1311 aa26.43■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.43■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.42■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 KIF1BO60333 1816 aa26.4■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 C8orf37Q96NL8 207 aa26.4■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 NAIPQ13075 1403 aa26.39■■□□□ 1.82
PSME3-216ENST00000593111 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.39■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.35■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.34■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 ADAMTS2O95450 1211 aa26.33■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.33■■□□□ 1.81
PSME3-216ENST00000593111 NGLY1Q96IV0 654 aa26.32■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 ORAI2Q96SN7 254 aa26.32■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.32■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.32■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 PTCH1Q13635 1447 aa26.28■■□□□ 1.8
PSME3-216ENST00000593111 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PSME3-216ENST00000593111 HFM1A2PYH4 1435 aa26.24■■□□□ 1.79
PSME3-216ENST00000593111 FOXD1Q16676 465 aa26.24■■□□□ 1.79
PSME3-216ENST00000593111 USP21Q9UK80 565 aa26.21■■□□□ 1.79
PSME3-216ENST00000593111 RGL3Q3MIN7 710 aa26.2■■□□□ 1.78
PSME3-216ENST00000593111 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.2■■□□□ 1.78
PSME3-216ENST00000593111 RGS12O14924 1447 aa26.2■■□□□ 1.78
PSME3-216ENST00000593111 STK26Q9P289 416 aa26.19■■□□□ 1.78
PSME3-216ENST00000593111 LAMC1P11047 1609 aa26.18■■□□□ 1.78
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