RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591307.5

BECN1-218, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 2

Gene BECN1, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-218ENST00000591307 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.68■■□□□ 1.86
BECN1-218ENST00000591307 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.66■■□□□ 1.86
BECN1-218ENST00000591307 BCANQ96GW7 911 aa26.64■■□□□ 1.86
BECN1-218ENST00000591307 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 ALKQ9UM73 1620 aa26.61■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.6■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 KCNA6P17658 529 aa26.59■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 PIP4K2BP78356 416 aa26.59■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 FOXD1Q16676 465 aa26.59■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 CLTCL1P53675 1640 aa26.58■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
BECN1-218ENST00000591307 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 TOM1O60784 492 aa26.56■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 TRPM2O94759 1503 aa26.55■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.54■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 TBX22Q9Y458 520 aa26.53■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
BECN1-218ENST00000591307 TMEM94Q12767 1356 aa26.5■■□□□ 1.83
BECN1-218ENST00000591307 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.5■■□□□ 1.83
BECN1-218ENST00000591307 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
BECN1-218ENST00000591307 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.48■■□□□ 1.83
BECN1-218ENST00000591307 HSPA1LP34931 641 aa26.48■■□□□ 1.83
BECN1-218ENST00000591307 NWD1Q149M9 1564 aa26.47■■□□□ 1.83
BECN1-218ENST00000591307 KIF1BO60333 1816 aa26.45■■□□□ 1.82
BECN1-218ENST00000591307 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.43■■□□□ 1.82
BECN1-218ENST00000591307 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.43■■□□□ 1.82
BECN1-218ENST00000591307 PTPRUQ92729 1446 aa26.42■■□□□ 1.82
BECN1-218ENST00000591307 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.42■■□□□ 1.82
BECN1-218ENST00000591307 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
BECN1-218ENST00000591307 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.38■■□□□ 1.81
BECN1-218ENST00000591307 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.37■■□□□ 1.81
BECN1-218ENST00000591307 DIP2AQ14689 1571 aa26.37■■□□□ 1.81
BECN1-218ENST00000591307 METP08581 1390 aa26.36■■□□□ 1.81
BECN1-218ENST00000591307 PIK3R4Q99570 1358 aa26.35■■□□□ 1.81
BECN1-218ENST00000591307 RGL3Q3MIN7 710 aa26.33■■□□□ 1.81
BECN1-218ENST00000591307 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.3■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.3■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.3■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 MSH6P52701 1360 aa26.29■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.29■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 PPLO60437 1756 aa26.28■■□□□ 1.8
BECN1-218ENST00000591307 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.26■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.26■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 C14orf37Q86TY3 774 aa26.25■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 SLAIN2Q9P270 581 aa26.25■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.23■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 ILDR2Q71H61 639 aa26.21■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.21■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.21■■□□□ 1.79
BECN1-218ENST00000591307 HRCP23327 699 aa26.19■■□□□ 1.78
BECN1-218ENST00000591307 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.17■■□□□ 1.78
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BECN1-218ENST00000591307 ATF3P18847 181 aa26.15■■□□□ 1.78
BECN1-218ENST00000591307 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.14■■□□□ 1.78
BECN1-218ENST00000591307 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.14■■□□□ 1.78
BECN1-218ENST00000591307 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
BECN1-218ENST00000591307 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.11■■□□□ 1.77
BECN1-218ENST00000591307 STK26Q9P289 416 aa26.07■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.07■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 PIK3C2GO75747 1445 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 BRINP3Q76B58 766 aa26.05■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 MST1RQ04912 1400 aa26.05■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 PTCH1Q13635 1447 aa26.05■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 PHLPP1O60346 1717 aa26.04■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 DCCP43146 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.03■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.03■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.02■■□□□ 1.76
BECN1-218ENST00000591307 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.01■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26■■□□□ 1.75
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BECN1-218ENST00000591307 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.98■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 MYOM2P54296 1465 aa25.98■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 ABCC11Q96J66 1382 aa25.96■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.96■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
BECN1-218ENST00000591307 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 TECPR2O15040 1411 aa25.95■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.94■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 ORAI2Q96SN7 254 aa25.93■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 JCADQ9P266 1359 aa25.92■■□□□ 1.74
BECN1-218ENST00000591307 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.89■■□□□ 1.74
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