RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE9O95405 1425 aa39.74■■■■□ 3.95
CAPNS1-211ENST00000590874 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
CAPNS1-211ENST00000590874 BCANQ96GW7 911 aa39.7■■■■□ 3.95
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC13BO14795 1591 aa39.67■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.65■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.65■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.65■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.63■■■■□ 3.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MSH6P52701 1360 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ROCK1Q13464 1354 aa39.57■■■■□ 3.92
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PCH4 1651 aa39.56■■■■□ 3.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
CAPNS1-211ENST00000590874 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.51■■■■□ 3.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SLAIN2Q9P270 581 aa39.49■■■■□ 3.91
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX22Q9Y458 520 aa39.49■■■■□ 3.91
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa39.48■■■■□ 3.91
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP155O75694 1391 aa39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEAQ6S8J7 498 aa39.41■■■■□ 3.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGAEP38570 1179 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-211ENST00000590874 DIP2AQ14689 1571 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLPP1O60346 1717 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3R4Q99570 1358 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-211ENST00000590874 JCADQ9P266 1359 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf37Q86TY3 774 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-211ENST00000590874 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRUQ92729 1446 aa39.29■■■■□ 3.88
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM2O94759 1503 aa39.29■■■■□ 3.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-211ENST00000590874 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.25■■■■□ 3.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF3P18847 181 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-211ENST00000590874 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-211ENST00000590874 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP6O75581 1613 aa39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-211ENST00000590874 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.14■■■■□ 3.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-211ENST00000590874 BRINP3Q76B58 766 aa39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-211ENST00000590874 METP08581 1390 aa39.09■■■■□ 3.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DCCP43146 1447 aa39.09■■■■□ 3.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CLTCL1P53675 1640 aa39.07■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SHPRHQ149N8 1683 aa39.06■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.04■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.03■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MST1RQ04912 1400 aa39.02■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
CAPNS1-211ENST00000590874 NAIPQ13075 1403 aa38.99■■■■□ 3.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa38.94■■■■□ 3.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NHSL1Q5SYE7 1610 aa38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NALCNQ8IZF0 1738 aa38.88■■■■□ 3.81
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF1BO60333 1816 aa38.85■■■■□ 3.81
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM52Q96A61 297 aa38.85■■■■□ 3.81
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 HFM1A2PYH4 1435 aa38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCH1Q13635 1447 aa38.79■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 AFF2P51816 1311 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA6Q8IY17 1366 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 VGFO15240 615 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 RXRBP28702 533 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf167Q5SNV9 1468 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ROBO2Q9HCK4 1378 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-211ENST00000590874 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP38.73■■■■□ 3.798e-10■■■■■ 28.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAG1Q86YV5 1406 aa38.71■■■■□ 3.79
CAPNS1-211ENST00000590874 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf37Q96NL8 207 aa38.67■■■■□ 3.78
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMC1P11047 1609 aa38.65■■■■□ 3.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ORAI2Q96SN7 254 aa38.65■■■■□ 3.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PPLO60437 1756 aa38.64■■■■□ 3.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXD1Q16676 465 aa38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-211ENST00000590874 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS12O14924 1447 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS2O95450 1211 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-211ENST00000590874 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CAPNS1-211ENST00000590874 NGLY1Q96IV0 654 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa38.48■■■■□ 3.75
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