RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 SLAIN2Q9P270 581 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRS-208ENST00000590509 ZFYVE9O95405 1425 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRS-208ENST00000590509 MSH6P52701 1360 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRS-208ENST00000590509 JCADQ9P266 1359 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRS-208ENST00000590509 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRS-208ENST00000590509 BCANQ96GW7 911 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRS-208ENST00000590509 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM52Q96A61 297 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 ADGRL2O95490 1459 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 TBX22Q9Y458 520 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 SHPRHQ149N8 1683 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRS-208ENST00000590509 DIP2AQ14689 1571 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 PTPRUQ92729 1446 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 E9PCH4 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 C14orf37Q86TY3 774 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 BRINP3Q76B58 766 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 UNC13BO14795 1591 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 ATF3P18847 181 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 APLP2Q06481 763 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRS-208ENST00000590509 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 RXRBP28702 533 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 AFF2P51816 1311 aa25■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 PIK3R4Q99570 1358 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 TRPM2O94759 1503 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 MST1RQ04912 1400 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRS-208ENST00000590509 RGS12O14924 1447 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRS-208ENST00000590509 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRS-208ENST00000590509 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRS-208ENST00000590509 METP08581 1390 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRS-208ENST00000590509 DCCP43146 1447 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRS-208ENST00000590509 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRS-208ENST00000590509 C8orf37Q96NL8 207 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRS-208ENST00000590509 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRS-208ENST00000590509 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRS-208ENST00000590509 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRS-208ENST00000590509 NUP155O75694 1391 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 ADAMTS2O95450 1211 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 ROCK1Q13464 1354 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRS-208ENST00000590509 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 CLTCL1P53675 1640 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 ITGAEP38570 1179 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 NGLY1Q96IV0 654 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 ORAI2Q96SN7 254 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 LAMC1P11047 1609 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRS-208ENST00000590509 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRS-208ENST00000590509 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRS-208ENST00000590509 USP21Q9UK80 565 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRS-208ENST00000590509 ATRNO75882 1429 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRS-208ENST00000590509 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRS-208ENST00000590509 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 EP400Q96L91 3159 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 PTCH1Q13635 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 MYOM2P54296 1465 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 KIF1BO60333 1816 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRS-208ENST00000590509 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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