RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.29■■■■□ 3.56
TOMM40-205ENST00000589649 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.29■■■■□ 3.56
TOMM40-205ENST00000589649 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.29■■■■□ 3.56
TOMM40-205ENST00000589649 ZFYVE9O95405 1425 aa37.28■■■■□ 3.56
TOMM40-205ENST00000589649 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
TOMM40-205ENST00000589649 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 KCNA6P17658 529 aa37.25■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 NAIPQ13075 1403 aa37.22■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 ILDR2Q71H61 639 aa37.22■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.2■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
TOMM40-205ENST00000589649 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
TOMM40-205ENST00000589649 TMEM94Q12767 1356 aa37.18■■■■□ 3.54
TOMM40-205ENST00000589649 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
TOMM40-205ENST00000589649 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.15■■■■□ 3.54
TOMM40-205ENST00000589649 TRIM52Q96A61 297 aa37.08■■■■□ 3.53
TOMM40-205ENST00000589649 TBX22Q9Y458 520 aa37.07■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 NWD1Q149M9 1564 aa37.07■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 HFM1A2PYH4 1435 aa37.06■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.05■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.04■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
TOMM40-205ENST00000589649 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
TOMM40-205ENST00000589649 CLTCL1P53675 1640 aa36.95■■■■□ 3.51
TOMM40-205ENST00000589649 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
TOMM40-205ENST00000589649 TRPM2O94759 1503 aa36.92■■■■□ 3.5
TOMM40-205ENST00000589649 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
TOMM40-205ENST00000589649 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.92■■■■□ 3.5
TOMM40-205ENST00000589649 MSH6P52701 1360 aa36.91■■■■□ 3.5
TOMM40-205ENST00000589649 DIP2AQ14689 1571 aa36.89■■■■□ 3.5
TOMM40-205ENST00000589649 PTPRUQ92729 1446 aa36.88■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.87■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 PIK3R4Q99570 1358 aa36.86■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 FOXD1Q16676 465 aa36.85■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 C14orf37Q86TY3 774 aa36.84■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.84■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 SLAIN2Q9P270 581 aa36.83■■■■□ 3.49
TOMM40-205ENST00000589649 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.81■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 SOCS7O14512 581 aa36.81■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.8■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.79■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 METP08581 1390 aa36.78■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.76■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 KIF1BO60333 1816 aa36.76■■■■□ 3.48
TOMM40-205ENST00000589649 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
TOMM40-205ENST00000589649 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.73■■■■□ 3.47
TOMM40-205ENST00000589649 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.7■■■■□ 3.47
TOMM40-205ENST00000589649 ATF3P18847 181 aa36.68■■■■□ 3.46
TOMM40-205ENST00000589649 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
TOMM40-205ENST00000589649 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.67■■■■□ 3.46
TOMM40-205ENST00000589649 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
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TOMM40-205ENST00000589649 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.62■■■■□ 3.45
TOMM40-205ENST00000589649 PHLPP1O60346 1717 aa36.58■■■■□ 3.45
TOMM40-205ENST00000589649 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.58■■■■□ 3.45
TOMM40-205ENST00000589649 RGL3Q3MIN7 710 aa36.57■■■■□ 3.44
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.57■■■■□ 3.44
TOMM40-205ENST00000589649 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
TOMM40-205ENST00000589649 BRINP3Q76B58 766 aa36.52■■■■□ 3.44
TOMM40-205ENST00000589649 PPLO60437 1756 aa36.52■■■■□ 3.44
TOMM40-205ENST00000589649 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.5■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 JCADQ9P266 1359 aa36.49■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 DCCP43146 1447 aa36.49■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.49■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.47■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.47■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 MST1RQ04912 1400 aa36.46■■■■□ 3.43
TOMM40-205ENST00000589649 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-205ENST00000589649 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-205ENST00000589649 PTCH1Q13635 1447 aa36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-205ENST00000589649 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.39■■■■□ 3.42
TOMM40-205ENST00000589649 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
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TOMM40-205ENST00000589649 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
TOMM40-205ENST00000589649 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.36■■■■□ 3.41
TOMM40-205ENST00000589649 STK26Q9P289 416 aa36.34■■■■□ 3.41
TOMM40-205ENST00000589649 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.32■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.32■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 IFT172Q9UG01 1749 aa36.31■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 LRP6O75581 1613 aa36.3■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.3■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.3■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.26■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 ORAI2Q96SN7 254 aa36.26■■■■□ 3.4
TOMM40-205ENST00000589649 PIK3C2GO75747 1445 aa36.25■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.23■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 SHPRHQ149N8 1683 aa36.23■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
TOMM40-205ENST00000589649 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.19■■■■□ 3.38
TOMM40-205ENST00000589649 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.18■■■■□ 3.38
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