RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TOM1O60784 492 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRB3O60242 1522 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ALKQ9UM73 1620 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP4K2BP78356 416 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-204ENST00000587718 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.51■■■■□ 3.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP155O75694 1391 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-204ENST00000587718 E9PCH4 1651 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFYVE9O95405 1425 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA1LP34931 641 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNA6P17658 529 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-204ENST00000587718 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-204ENST00000587718 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-204ENST00000587718 ILDR2Q71H61 639 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-204ENST00000587718 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-204ENST00000587718 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM94Q12767 1356 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-204ENST00000587718 BCANQ96GW7 911 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-204ENST00000587718 NWD1Q149M9 1564 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-204ENST00000587718 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.26■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 TBX22Q9Y458 520 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 MIER1Q8N108 512 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TONSLQ96HA7 1378 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-204ENST00000587718 NEUROD1Q13562 356 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3R4Q99570 1358 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-204ENST00000587718 DIP2AQ14689 1571 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPM2O94759 1503 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SOCS7O14512 581 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MSH6P52701 1360 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-204ENST00000587718 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CLTCL1P53675 1640 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM52Q96A61 297 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRUQ92729 1446 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SLAIN2Q9P270 581 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-204ENST00000587718 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-204ENST00000587718 METP08581 1390 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF1BO60333 1816 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf37Q86TY3 774 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-204ENST00000587718 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-204ENST00000587718 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXD1Q16676 465 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ATF3P18847 181 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-204ENST00000587718 DCCP43146 1447 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PHLPP1O60346 1717 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-204ENST00000587718 JCADQ9P266 1359 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 BRINP3Q76B58 766 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 PPLO60437 1756 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 MST1RQ04912 1400 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 PTCH1Q13635 1447 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 RGL3Q3MIN7 710 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CCER2I3L3R5 266 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms