RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 ZFYVE9O95405 1425 aa29.4■■■□□ 2.3
UBXN6-204ENST00000587324 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.37■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 APLP2Q06481 763 aa29.36■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 PHLPP1O60346 1717 aa29.36■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 POTEAQ6S8J7 498 aa29.35■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.33■■■□□ 2.29
UBXN6-204ENST00000587324 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 UNC13BO14795 1591 aa29.32■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.32■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.3■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.29■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 E9PCH4 1651 aa29.29■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 MSH6P52701 1360 aa29.27■■■□□ 2.28
UBXN6-204ENST00000587324 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
UBXN6-204ENST00000587324 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.22■■■□□ 2.27
UBXN6-204ENST00000587324 BCANQ96GW7 911 aa29.22■■■□□ 2.27
UBXN6-204ENST00000587324 SLAIN2Q9P270 581 aa29.21■■■□□ 2.27
UBXN6-204ENST00000587324 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
UBXN6-204ENST00000587324 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.2■■■□□ 2.26
UBXN6-204ENST00000587324 LRP6O75581 1613 aa29.18■■■□□ 2.26
UBXN6-204ENST00000587324 DIP2AQ14689 1571 aa29.18■■■□□ 2.26
UBXN6-204ENST00000587324 JCADQ9P266 1359 aa29.17■■■□□ 2.26
UBXN6-204ENST00000587324 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
UBXN6-204ENST00000587324 TBX22Q9Y458 520 aa29.14■■■□□ 2.26
UBXN6-204ENST00000587324 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
UBXN6-204ENST00000587324 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
UBXN6-204ENST00000587324 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.12■■■□□ 2.25
UBXN6-204ENST00000587324 SHPRHQ149N8 1683 aa29.12■■■□□ 2.25
UBXN6-204ENST00000587324 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.11■■■□□ 2.25
UBXN6-204ENST00000587324 PTPRUQ92729 1446 aa29.09■■■□□ 2.25
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UBXN6-204ENST00000587324 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 TRPM2O94759 1503 aa29.06■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 ROCK1Q13464 1354 aa29.05■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 PIK3R4Q99570 1358 aa29.05■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.03■■■□□ 2.24
UBXN6-204ENST00000587324 C14orf37Q86TY3 774 aa29■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.99■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.98■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.98■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.98■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 NUP155O75694 1391 aa28.97■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.97■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.96■■■□□ 2.23
UBXN6-204ENST00000587324 BRINP3Q76B58 766 aa28.95■■■□□ 2.22
UBXN6-204ENST00000587324 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.94■■■□□ 2.22
UBXN6-204ENST00000587324 ATF3P18847 181 aa28.94■■■□□ 2.22
UBXN6-204ENST00000587324 DCCP43146 1447 aa28.93■■■□□ 2.22
UBXN6-204ENST00000587324 MST1RQ04912 1400 aa28.91■■■□□ 2.22
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UBXN6-204ENST00000587324 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.85■■■□□ 2.21
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UBXN6-204ENST00000587324 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
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UBXN6-204ENST00000587324 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
UBXN6-204ENST00000587324 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
UBXN6-204ENST00000587324 KIF1BO60333 1816 aa28.79■■■□□ 2.2
UBXN6-204ENST00000587324 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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UBXN6-204ENST00000587324 PTCH1Q13635 1447 aa28.67■■■□□ 2.18
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UBXN6-204ENST00000587324 C8orf37Q96NL8 207 aa28.64■■■□□ 2.18
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UBXN6-204ENST00000587324 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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UBXN6-204ENST00000587324 ORAI2Q96SN7 254 aa28.56■■■□□ 2.16
UBXN6-204ENST00000587324 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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UBXN6-204ENST00000587324 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.5■■■□□ 2.15
UBXN6-204ENST00000587324 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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UBXN6-204ENST00000587324 HFM1A2PYH4 1435 aa28.48■■■□□ 2.15
UBXN6-204ENST00000587324 MYOM2P54296 1465 aa28.47■■■□□ 2.15
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