RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-215ENST00000582821 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.86■□□□□ 0.93
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GGA3-215ENST00000582821 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.83■□□□□ 0.93
GGA3-215ENST00000582821 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.82■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.81■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 HRCP23327 699 aa20.8■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 CLTCL1P53675 1640 aa20.79■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.78■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.78■□□□□ 0.92
GGA3-215ENST00000582821 KIF1BO60333 1816 aa20.78■□□□□ 0.92
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GGA3-215ENST00000582821 TBX22Q9Y458 520 aa20.77■□□□□ 0.92
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GGA3-215ENST00000582821 BCANQ96GW7 911 aa20.75■□□□□ 0.91
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GGA3-215ENST00000582821 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.71■□□□□ 0.91
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GGA3-215ENST00000582821 PIK3R4Q99570 1358 aa20.69■□□□□ 0.9
GGA3-215ENST00000582821 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.68■□□□□ 0.9
GGA3-215ENST00000582821 DIP2AQ14689 1571 aa20.68■□□□□ 0.9
GGA3-215ENST00000582821 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.68■□□□□ 0.9
GGA3-215ENST00000582821 NWD1Q149M9 1564 aa20.68■□□□□ 0.9
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GGA3-215ENST00000582821 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.59■□□□□ 0.89
GGA3-215ENST00000582821 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.59■□□□□ 0.89
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GGA3-215ENST00000582821 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.49■□□□□ 0.87
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GGA3-215ENST00000582821 PIK3C2GO75747 1445 aa20.44■□□□□ 0.86
GGA3-215ENST00000582821 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.44■□□□□ 0.86
GGA3-215ENST00000582821 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.44■□□□□ 0.86
GGA3-215ENST00000582821 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GGA3-215ENST00000582821 MYOM2P54296 1465 aa20.43■□□□□ 0.86
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GGA3-215ENST00000582821 DCCP43146 1447 aa20.41■□□□□ 0.86
GGA3-215ENST00000582821 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.39■□□□□ 0.85
GGA3-215ENST00000582821 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.37■□□□□ 0.85
GGA3-215ENST00000582821 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GGA3-215ENST00000582821 ABCC11Q96J66 1382 aa20.37■□□□□ 0.85
GGA3-215ENST00000582821 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.37■□□□□ 0.85
GGA3-215ENST00000582821 TECPR2O15040 1411 aa20.36■□□□□ 0.85
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GGA3-215ENST00000582821 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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GGA3-215ENST00000582821 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.28■□□□□ 0.84
GGA3-215ENST00000582821 ADGRB1O14514 1584 aa20.26■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 PHLPP1O60346 1717 aa20.24■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.24■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.24■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.23■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 DLC1Q96QB1 1528 aa20.23■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.23■□□□□ 0.83
GGA3-215ENST00000582821 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.21■□□□□ 0.83
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