RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-208ENST00000579358 IQGAP1P46940 1657 aa14.81□□□□□ -0.04
MKS1-208ENST00000579358 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.8□□□□□ -0.04
MKS1-208ENST00000579358 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
MKS1-208ENST00000579358 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
MKS1-208ENST00000579358 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.77□□□□□ -0.04
MKS1-208ENST00000579358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.77□□□□□ -0.04
MKS1-208ENST00000579358 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.76□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.76□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.76□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 CERKQ8TCT0 537 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 CPS1P31327 1500 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 KIF1BO60333 1816 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 DIP2AQ14689 1571 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 BCANQ96GW7 911 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 TBX22Q9Y458 520 aa14.71□□□□□ -0.05
MKS1-208ENST00000579358 PIK3R4Q99570 1358 aa14.7□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 KCNA6P17658 529 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 NWD1Q149M9 1564 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 RGL3Q3MIN7 710 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 PPLO60437 1756 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 MYOM2P54296 1465 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-208ENST00000579358 FBXO41Q8TF61 875 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 STAC3Q96MF2 364 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 PIK3C2GO75747 1445 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 IFT172Q9UG01 1749 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 METP08581 1390 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 PTPRUQ92729 1446 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 ALKQ9UM73 1620 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 TMEM94Q12767 1356 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-208ENST00000579358 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.57□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 PTCH1Q13635 1447 aa14.56□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 LAMC1P11047 1609 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 TOM1O60784 492 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 TECPR2O15040 1411 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 MSH6P52701 1360 aa14.52□□□□□ -0.08
MKS1-208ENST00000579358 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 ABCC11Q96J66 1382 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 DCCP43146 1447 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 NEUROD1Q13562 356 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 ADGRB1O14514 1584 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.48□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 C14orf37Q86TY3 774 aa14.48□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.48□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 SIRT1Q96EB6 747 aa14.47□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.46□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.46□□□□□ -0.09
MKS1-208ENST00000579358 TONSLQ96HA7 1378 aa14.46□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 DLC1Q96QB1 1528 aa14.46□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 PIP4K2BP78356 416 aa14.45□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 STK26Q9P289 416 aa14.45□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 ATF3P18847 181 aa14.44□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.44□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 SLAIN2Q9P270 581 aa14.42□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.41□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.41□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 MST1RQ04912 1400 aa14.41□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.4□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.4□□□□□ -0.1
MKS1-208ENST00000579358 PRAM1Q96QH2 718 aa14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms