RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS2-208ENST00000576635 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS2-208ENST00000576635 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.08■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 ZFYVE9O95405 1425 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 UNC13BO14795 1591 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 BCANQ96GW7 911 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS2-208ENST00000576635 E9PCH4 1651 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-208ENST00000576635 PHLPP1O60346 1717 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-208ENST00000576635 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-208ENST00000576635 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24■■□□□ 1.43
SPNS2-208ENST00000576635 MSH6P52701 1360 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS2-208ENST00000576635 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 POTEAQ6S8J7 498 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 SLAIN2Q9P270 581 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS2-208ENST00000576635 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 DIP2AQ14689 1571 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 TBX22Q9Y458 520 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 ROCK1Q13464 1354 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 JCADQ9P266 1359 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS2-208ENST00000576635 C14orf37Q86TY3 774 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 TRPM2O94759 1503 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 PIK3R4Q99570 1358 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 LRP6O75581 1613 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 NUP155O75694 1391 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 SHPRHQ149N8 1683 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 PTPRUQ92729 1446 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS2-208ENST00000576635 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 ITGAEP38570 1179 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 ATF3P18847 181 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS2-208ENST00000576635 DCCP43146 1447 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 BRINP3Q76B58 766 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 CLTCL1P53675 1640 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS2-208ENST00000576635 MST1RQ04912 1400 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 METP08581 1390 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 KIF1BO60333 1816 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 TRIM52Q96A61 297 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS2-208ENST00000576635 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-208ENST00000576635 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
SPNS2-208ENST00000576635 RXRBP28702 533 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-208ENST00000576635 AFF2P51816 1311 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS2-208ENST00000576635 NAIPQ13075 1403 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 LAMC1P11047 1609 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 PTCH1Q13635 1447 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 PPLO60437 1756 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS2-208ENST00000576635 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS2-208ENST00000576635 C8orf37Q96NL8 207 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS2-208ENST00000576635 RGS12O14924 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-208ENST00000576635 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-208ENST00000576635 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS2-208ENST00000576635 ORAI2Q96SN7 254 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 HFM1A2PYH4 1435 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 ADAMTS2O95450 1211 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 NGLY1Q96IV0 654 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS2-208ENST00000576635 IFT172Q9UG01 1749 aa23.31■■□□□ 1.32
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