RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC40-211ENST00000574099 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.42■■□□□ 1.98
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CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.23■■□□□ 1.95
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CCDC40-211ENST00000574099 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.2■■□□□ 1.94
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CCDC40-211ENST00000574099 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.17■■□□□ 1.94
CCDC40-211ENST00000574099 PIK3R4Q99570 1358 aa27.16■■□□□ 1.94
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CCDC40-211ENST00000574099 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
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CCDC40-211ENST00000574099 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.71■■□□□ 1.87
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CCDC40-211ENST00000574099 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CCDC40-211ENST00000574099 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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CCDC40-211ENST00000574099 ATRNO75882 1429 aa26.65■■□□□ 1.86
CCDC40-211ENST00000574099 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CCDC40-211ENST00000574099 PPLO60437 1756 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 HFM1A2PYH4 1435 aa26.62■■□□□ 1.85
CCDC40-211ENST00000574099 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.62■■□□□ 1.85
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