RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-209ENST00000567316 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 FBXO41Q8TF61 875 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-209ENST00000567316 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 MED14O60244 1454 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 MYOM2P54296 1465 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 SLIT1O75093 1534 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.17■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 ZFYVE9O95405 1425 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.14■■□□□ 1.14
CTU2-209ENST00000567316 STAC3Q96MF2 364 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 IQGAP1P46940 1657 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 LAMC1P11047 1609 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 CERKQ8TCT0 537 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-209ENST00000567316 LTKP29376 864 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 PIK3C2GO75747 1445 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 EID1Q9Y6B2 187 aa22.05■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.04■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.04■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 ALKQ9UM73 1620 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-209ENST00000567316 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 CPS1P31327 1500 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 DIP2AQ14689 1571 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.96■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 ADGRB1O14514 1584 aa21.95■■□□□ 1.11
CTU2-209ENST00000567316 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.94■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.93■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 BCANQ96GW7 911 aa21.91■■□□□ 1.1
CTU2-209ENST00000567316 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.88■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 TBX22Q9Y458 520 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 METP08581 1390 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-209ENST00000567316 NWD1Q149M9 1564 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 KCNA6P17658 529 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 USP47Q96K76 1375 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 DLC1Q96QB1 1528 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 PTPRUQ92729 1446 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 PIK3R4Q99570 1358 aa21.79■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 STK26Q9P289 416 aa21.77■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.77■■□□□ 1.08
CTU2-209ENST00000567316 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 ABCC11Q96J66 1382 aa21.76■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 TECPR2O15040 1411 aa21.76■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.72■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.72■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.71■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CTU2-209ENST00000567316 TOM1O60784 492 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-209ENST00000567316 SIRT1Q96EB6 747 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-209ENST00000567316 PTCH1Q13635 1447 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-209ENST00000567316 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-209ENST00000567316 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTU2-209ENST00000567316 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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