RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 E9PCH4 1651 aa25.75■■□□□ 1.71
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.73■■□□□ 1.71
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IFT172Q9UG01 1749 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.03■■□□□ 1.6
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ORAI2Q96SN7 254 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AFF2P51816 1311 aa24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RGL3Q3MIN7 710 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RXRBP28702 533 aa24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C8orf37Q96NL8 207 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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