RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.84■■■□□ 2.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LTKP29376 864 aa27.82■■■□□ 2.04
RABGGTA-208ENST00000558954 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.82■■■□□ 2.04
RABGGTA-208ENST00000558954 IFT172Q9UG01 1749 aa27.81■■■□□ 2.04
RABGGTA-208ENST00000558954 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.75■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 DIP2AQ14689 1571 aa27.73■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.73■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.72■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.7■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.7■■■□□ 2.03
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CPS1P31327 1500 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-208ENST00000558954 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
RABGGTA-208ENST00000558954 BCANQ96GW7 911 aa27.65■■■□□ 2.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NWD1Q149M9 1564 aa27.63■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.6■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.58■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 RGL3Q3MIN7 710 aa27.58■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.58■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
RABGGTA-208ENST00000558954 MYOM2P54296 1465 aa27.57■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 CERKQ8TCT0 537 aa27.55■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMC1P11047 1609 aa27.55■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 TBX22Q9Y458 520 aa27.54■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 ALKQ9UM73 1620 aa27.53■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3R4Q99570 1358 aa27.53■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-208ENST00000558954 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3C2GO75747 1445 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNA6P17658 529 aa27.47■■□□□ 1.99
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.45■■□□□ 1.99
RABGGTA-208ENST00000558954 METP08581 1390 aa27.42■■□□□ 1.98
RABGGTA-208ENST00000558954 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.41■■□□□ 1.98
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPRUQ92729 1446 aa27.41■■□□□ 1.98
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.39■■□□□ 1.98
RABGGTA-208ENST00000558954 STAC3Q96MF2 364 aa27.39■■□□□ 1.98
RABGGTA-208ENST00000558954 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.38■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.37■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM94Q12767 1356 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.34■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.33■■□□□ 1.97
RABGGTA-208ENST00000558954 PTCH1Q13635 1447 aa27.33■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO41Q8TF61 875 aa27.32■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NEUROD1Q13562 356 aa27.31■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.3■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.3■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRB1O14514 1584 aa27.27■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 TECPR2O15040 1411 aa27.27■■□□□ 1.96
RABGGTA-208ENST00000558954 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 MSH6P52701 1360 aa27.25■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.24■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.24■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.24■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.24■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 TONSLQ96HA7 1378 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 TOM1O60784 492 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 C14orf37Q86TY3 774 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.2■■□□□ 1.94
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCC11Q96J66 1382 aa27.2■■□□□ 1.94
RABGGTA-208ENST00000558954 DLC1Q96QB1 1528 aa27.19■■□□□ 1.94
RABGGTA-208ENST00000558954 DCCP43146 1447 aa27.18■■□□□ 1.94
RABGGTA-208ENST00000558954 STK26Q9P289 416 aa27.16■■□□□ 1.94
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.15■■□□□ 1.94
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.14■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.13■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.12■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.09■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 ATF3P18847 181 aa27.08■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 PIP4K2BP78356 416 aa27.08■■□□□ 1.93
RABGGTA-208ENST00000558954 SIRT1Q96EB6 747 aa27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.06■■□□□ 1.92
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