RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPLO60437 1756 aa24.42■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.42■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYOM2P54296 1465 aa24.41■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.39■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.39■■□□□ 1.5
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.35■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFYVE9O95405 1425 aa24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.33■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.32■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.32■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3C2GO75747 1445 aa24.29■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLIT1O75093 1534 aa24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 EID1Q9Y6B2 187 aa24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.27■■□□□ 1.48
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP47Q96K76 1375 aa24.23■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 LTKP29376 864 aa24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAMC1P11047 1609 aa24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.2■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCANQ96GW7 911 aa24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.18■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.16■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALKQ9UM73 1620 aa24.14■■□□□ 1.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.13■■□□□ 1.45
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USP3-AS1-201ENST00000558831 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRB1O14514 1584 aa24.1■■□□□ 1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.1■■□□□ 1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.08■■□□□ 1.44
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USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPA2P54652 639 aa24.06■■□□□ 1.44
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USP3-AS1-201ENST00000558831 DIP2AQ14689 1571 aa24.05■■□□□ 1.44
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USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.04■■□□□ 1.44
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USP3-AS1-201ENST00000558831 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED14O60244 1454 aa24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBX22Q9Y458 520 aa24.03■■□□□ 1.44
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USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 METP08581 1390 aa24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 STK26Q9P289 416 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC7Q96M83 1385 aa24■■□□□ 1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC11Q96J66 1382 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3R4Q99570 1358 aa23.95■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 TESK2Q96S53 571 aa23.95■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMF1P82094 1093 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 DLC1Q96QB1 1528 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.92■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 TECPR2O15040 1411 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC24A1O60721 1099 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 POGKQ9P215 609 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRCQ7RTU9 1775 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPRUQ92729 1446 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRAM1Q96QH2 718 aa23.89■■□□□ 1.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIRT1Q96EB6 747 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPS1P31327 1500 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.87■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.87■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTCH1Q13635 1447 aa23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDCA8Q53HL2 280 aa23.83■■□□□ 1.41
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