RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UNC13BO14795 1591 aa21.02■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.02■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.02■□□□□ 0.96
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.02■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.99■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MSH6P52701 1360 aa20.97■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.96■□□□□ 0.95
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DIP2AQ14689 1571 aa20.95■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 E9PCH4 1651 aa20.93■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TBX22Q9Y458 520 aa20.93■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.93■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.93■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PHLPP1O60346 1717 aa20.92■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POTEAQ6S8J7 498 aa20.92■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ROCK1Q13464 1354 aa20.92■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PIK3R4Q99570 1358 aa20.91■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLAIN2Q9P270 581 aa20.91■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 JCADQ9P266 1359 aa20.9■□□□□ 0.94
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRPM2O94759 1503 aa20.83■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BCANQ96GW7 911 aa20.83■□□□□ 0.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SHPRHQ149N8 1683 aa20.82■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRP6O75581 1613 aa20.82■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DCCP43146 1447 aa20.81■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.81■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.8■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.8■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.8■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PTPRUQ92729 1446 aa20.79■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.78■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUP155O75694 1391 aa20.75■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.75■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.72■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATF3P18847 181 aa20.71■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BRINP3Q76B58 766 aa20.71■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.71■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.71■□□□□ 0.91
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MST1RQ04912 1400 aa20.7■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.7■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C14orf37Q86TY3 774 aa20.69■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.67■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.66■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 METP08581 1390 aa20.65■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CLTCL1P53675 1640 aa20.64■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LAMC1P11047 1609 aa20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.63■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.63■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PTCH1Q13635 1447 aa20.6■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.57■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF1BO60333 1816 aa20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NAIPQ13075 1403 aa20.55■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RXRBP28702 533 aa20.55■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.54■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AFF2P51816 1311 aa20.53■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITGAEP38570 1179 aa20.53■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM52Q96A61 297 aa20.52■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGS12O14924 1447 aa20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.49■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPLO60437 1756 aa20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HFM1A2PYH4 1435 aa20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.44■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C8orf37Q96NL8 207 aa20.42■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-201ENST00000558086 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYOM2P54296 1465 aa20.39■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TECPR2O15040 1411 aa20.39■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ORAI2Q96SN7 254 aa20.39■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PXDNQ92626 1479 aa20.37■□□□□ 0.85
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