RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555638.5

TMEM229B-205, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 2,812 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-205ENST00000555638 STAC3Q96MF2 364 aa22.33■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 DDIT3P35638 169 aa22.32■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 PDE3AQ14432 1141 aa22.32■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 SAMD9Q5K651 1589 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.31■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.3■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 ABCC5O15440 1437 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 PKD2Q13563 968 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 COG6Q9Y2V7 657 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM229B-205ENST00000555638 KIF20AO95235 890 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 HMGXB3Q12766 1538 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 PANK1Q8TE04 598 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 PANK3Q9H999 370 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 SMC5Q8IY18 1101 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 CUL7Q14999 1698 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM229B-205ENST00000555638 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 E9PSI1 815 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 MCM5P33992 734 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 SNX21Q969T3 373 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 PRDM2Q13029 1718 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 TMEM51Q9NW97 253 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 PPP2R1AP30153 589 aa22.14■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 ZNF445P59923 1031 aa22.14■■□□□ 1.14
TMEM229B-205ENST00000555638 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 CBX1P83916 185 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 NESP48681 1621 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 APAF1O14727 1248 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 RBSNQ9H1K0 784 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM229B-205ENST00000555638 TAF3Q5VWG9 929 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 SSFA2P28290 1259 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 TESK2Q96S53 571 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 PLXNC1O60486 1568 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 CEP170Q5SW79 1584 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 ERBINQ96RT1 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 ATP2B3Q16720 1220 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 ABCC2Q92887 1545 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 RLBP1P12271 317 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM229B-205ENST00000555638 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.02■■□□□ 1.11
TMEM229B-205ENST00000555638 TMF1P82094 1093 aa22.02■■□□□ 1.11
TMEM229B-205ENST00000555638 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM229B-205ENST00000555638 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM229B-205ENST00000555638 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms