RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 ROCK1Q13464 1354 aa26.19■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 ZFYVE9O95405 1425 aa26.18■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.17■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 KCNA6P17658 529 aa26.17■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.14■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 BCANQ96GW7 911 aa26.13■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.11■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.09■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.09■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 ITGAEP38570 1179 aa26.09■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TMX1-202ENST00000555574 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TMX1-202ENST00000555574 NUP155O75694 1391 aa26.06■■□□□ 1.76
TMX1-202ENST00000555574 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TMX1-202ENST00000555574 MSH6P52701 1360 aa26.02■■□□□ 1.76
TMX1-202ENST00000555574 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26■■□□□ 1.75
TMX1-202ENST00000555574 DIP2AQ14689 1571 aa26■■□□□ 1.75
TMX1-202ENST00000555574 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TMX1-202ENST00000555574 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
TMX1-202ENST00000555574 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.99■■□□□ 1.75
TMX1-202ENST00000555574 TBX22Q9Y458 520 aa25.97■■□□□ 1.75
TMX1-202ENST00000555574 PHLPP1O60346 1717 aa25.95■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 TRPM2O94759 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 SLAIN2Q9P270 581 aa25.92■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.9■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 PIK3R4Q99570 1358 aa25.9■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.89■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TMX1-202ENST00000555574 C14orf37Q86TY3 774 aa25.87■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 CLTCL1P53675 1640 aa25.87■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 PTPRUQ92729 1446 aa25.86■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.86■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 NAIPQ13075 1403 aa25.83■■□□□ 1.73
TMX1-202ENST00000555574 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.81■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 KIF1BO60333 1816 aa25.8■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 JCADQ9P266 1359 aa25.8■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.79■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.79■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.78■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 ATF3P18847 181 aa25.77■■□□□ 1.72
TMX1-202ENST00000555574 POTEAQ6S8J7 498 aa25.75■■□□□ 1.71
TMX1-202ENST00000555574 METP08581 1390 aa25.74■■□□□ 1.71
TMX1-202ENST00000555574 HFM1A2PYH4 1435 aa25.73■■□□□ 1.71
TMX1-202ENST00000555574 DCCP43146 1447 aa25.73■■□□□ 1.71
TMX1-202ENST00000555574 SHPRHQ149N8 1683 aa25.71■■□□□ 1.71
TMX1-202ENST00000555574 LRP6O75581 1613 aa25.7■■□□□ 1.71
TMX1-202ENST00000555574 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.69■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 TRIM52Q96A61 297 aa25.68■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.68■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 BRINP3Q76B58 766 aa25.67■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.66■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 MST1RQ04912 1400 aa25.66■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.65■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.65■■□□□ 1.7
TMX1-202ENST00000555574 PPLO60437 1756 aa25.62■■□□□ 1.69
TMX1-202ENST00000555574 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TMX1-202ENST00000555574 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TMX1-202ENST00000555574 PTCH1Q13635 1447 aa25.58■■□□□ 1.69
TMX1-202ENST00000555574 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.55■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.54■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 FOXD1Q16676 465 aa25.53■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.53■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.52■■□□□ 1.68
TMX1-202ENST00000555574 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.51■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 LAMC1P11047 1609 aa25.48■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 IFT172Q9UG01 1749 aa25.47■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.46■■□□□ 1.67
TMX1-202ENST00000555574 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.43■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 AFF2P51816 1311 aa25.41■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.41■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.41■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 ORAI2Q96SN7 254 aa25.4■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.4■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 RGL3Q3MIN7 710 aa25.39■■□□□ 1.66
TMX1-202ENST00000555574 RXRBP28702 533 aa25.37■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 C8orf37Q96NL8 207 aa25.37■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.37■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.36■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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