RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.62□□□□□ -0.07
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADGRL2O95490 1459 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NOS1P29475 1434 aa14.59□□□□□ -0.07
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TET3O43151 1660 aa14.58□□□□□ -0.08
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.56□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.56□□□□□ -0.08
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM94Q12767 1356 aa14.55□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCANQ96GW7 911 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.52□□□□□ -0.08
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NWD1Q149M9 1564 aa14.51□□□□□ -0.09
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAPN15O75808 1086 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZFYVE9O95405 1425 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MSH6P52701 1360 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UNC13BO14795 1591 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TBX22Q9Y458 520 aa14.46□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ROCK1Q13464 1354 aa14.46□□□□□ -0.1
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.44□□□□□ -0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.43□□□□□ -0.1
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.4□□□□□ -0.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 JCADQ9P266 1359 aa14.39□□□□□ -0.11
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 POTEAQ6S8J7 498 aa14.39□□□□□ -0.11
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.38□□□□□ -0.11
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATF3P18847 181 aa14.36□□□□□ -0.11
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.3□□□□□ -0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SHPRHQ149N8 1683 aa14.3□□□□□ -0.12
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 DCCP43146 1447 aa14.3□□□□□ -0.12
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLTCL1P53675 1640 aa14.25□□□□□ -0.13
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.24□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MST1RQ04912 1400 aa14.24□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.23□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.23□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NAIPQ13075 1403 aa14.22□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.22□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.21□□□□□ -0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RXRBP28702 533 aa14.2□□□□□ -0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRIM52Q96A61 297 aa14.19□□□□□ -0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.17□□□□□ -0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AFF2P51816 1311 aa14.16□□□□□ -0.14
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTCH1Q13635 1447 aa14.16□□□□□ -0.14
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