RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.11■■□□□ 1.77
PRRX1-208ENST00000553786 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.09■■□□□ 1.77
PRRX1-208ENST00000553786 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PRRX1-208ENST00000553786 MSH6P52701 1360 aa26.07■■□□□ 1.76
PRRX1-208ENST00000553786 ZFYVE9O95405 1425 aa26.05■■□□□ 1.76
PRRX1-208ENST00000553786 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PRRX1-208ENST00000553786 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.04■■□□□ 1.76
PRRX1-208ENST00000553786 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.02■■□□□ 1.76
PRRX1-208ENST00000553786 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 POTEAQ6S8J7 498 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 SLAIN2Q9P270 581 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 UNC13BO14795 1591 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRX1-208ENST00000553786 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 PHLPP1O60346 1717 aa25.94■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 JCADQ9P266 1359 aa25.94■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 TBX22Q9Y458 520 aa25.92■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 C14orf37Q86TY3 774 aa25.91■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.89■■□□□ 1.74
PRRX1-208ENST00000553786 E9PCH4 1651 aa25.88■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 DIP2AQ14689 1571 aa25.88■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.88■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.85■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 ROCK1Q13464 1354 aa25.85■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 PIK3R4Q99570 1358 aa25.83■■□□□ 1.73
PRRX1-208ENST00000553786 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.82■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 ATF3P18847 181 aa25.81■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.81■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 TRPM2O94759 1503 aa25.81■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 NUP155O75694 1391 aa25.81■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 LRP6O75581 1613 aa25.79■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.79■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PRRX1-208ENST00000553786 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.76■■□□□ 1.71
PRRX1-208ENST00000553786 PTPRUQ92729 1446 aa25.74■■□□□ 1.71
PRRX1-208ENST00000553786 ITGAEP38570 1179 aa25.74■■□□□ 1.71
PRRX1-208ENST00000553786 SHPRHQ149N8 1683 aa25.72■■□□□ 1.71
PRRX1-208ENST00000553786 DCCP43146 1447 aa25.71■■□□□ 1.71
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PRRX1-208ENST00000553786 BRINP3Q76B58 766 aa25.7■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.68■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM52Q96A61 297 aa25.65■■□□□ 1.7
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PRRX1-208ENST00000553786 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PRRX1-208ENST00000553786 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PRRX1-208ENST00000553786 MST1RQ04912 1400 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRX1-208ENST00000553786 METP08581 1390 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRX1-208ENST00000553786 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.59■■□□□ 1.69
PRRX1-208ENST00000553786 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.59■■□□□ 1.69
PRRX1-208ENST00000553786 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 RXRBP28702 533 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
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PRRX1-208ENST00000553786 CLTCL1P53675 1640 aa25.55■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 AFF2P51816 1311 aa25.55■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRX1-208ENST00000553786 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRX1-208ENST00000553786 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PRRX1-208ENST00000553786 C8orf37Q96NL8 207 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRX1-208ENST00000553786 PTCH1Q13635 1447 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRX1-208ENST00000553786 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.45■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 NAIPQ13075 1403 aa25.45■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 KIF1BO60333 1816 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 RGS12O14924 1447 aa25.43■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.42■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 ADAMTS2O95450 1211 aa25.39■■□□□ 1.66
PRRX1-208ENST00000553786 NGLY1Q96IV0 654 aa25.38■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.37■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 LAMC1P11047 1609 aa25.37■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 ORAI2Q96SN7 254 aa25.36■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.35■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 HFM1A2PYH4 1435 aa25.34■■□□□ 1.65
PRRX1-208ENST00000553786 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PRRX1-208ENST00000553786 USP21Q9UK80 565 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRX1-208ENST00000553786 PPLO60437 1756 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRX1-208ENST00000553786 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRX1-208ENST00000553786 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.26■■□□□ 1.63
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