RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	JCAD	Q9P266	1359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	ADGRB3	O60242	1522 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	ADGRL2	O95490	1459 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	NWD1	Q149M9	1564 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		10.59	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		10.59	□□□□□ -0.71
CS-233	ENST00000552688	ZFYVE9	O95405	1425 aa		10.58	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.58	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	PIK3R4	Q99570	1358 aa		10.58	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.58	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	ATF3	P18847	181 aa		10.57	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		10.53	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.53	□□□□□ -0.72
CS-233	ENST00000552688	RXRB	P28702	533 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	PHLPP1	O60346	1717 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	DIP2A	Q14689	1571 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	ROCK1	Q13464	1354 aa		10.52	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	BRINP3	Q76B58	766 aa		10.51	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	10.51	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	DCC	P43146	1447 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	TRIM52	Q96A61	297 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	NUP155	O75694	1391 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	LRP6	O75581	1613 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	TRPM2	O94759	1503 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	UNC13B	O14795	1591 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-233	ENST00000552688	PTPRU	Q92729	1446 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	SHPRH	Q149N8	1683 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	AFF2	P51816	1311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	MST1R	Q04912	1400 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688		E9PCH4	1651 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	MET	P08581	1390 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	C8orf37	Q96NL8	207 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	FOXD1	Q16676	465 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	ITGAE	P38570	1179 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-233	ENST00000552688	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	RGS12	O14924	1447 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	USP21	Q9UK80	565 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	ORAI2	Q96SN7	254 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CS-233	ENST00000552688	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	HFM1	A2PYH4	1435 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CS-233	ENST00000552688	LAMC1	P11047	1609 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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