RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.09■■□□□ 1.61
CS-227ENST00000551441 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CS-227ENST00000551441 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CS-227ENST00000551441 NWD1Q149M9 1564 aa25.08■■□□□ 1.61
CS-227ENST00000551441 MSH6P52701 1360 aa25.07■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.07■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 PHLPP1O60346 1717 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 SLAIN2Q9P270 581 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 ADGRL2O95490 1459 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 FOXD1Q16676 465 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 ZFYVE9O95405 1425 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-227ENST00000551441 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-227ENST00000551441 C14orf37Q86TY3 774 aa25■■□□□ 1.59
CS-227ENST00000551441 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-227ENST00000551441 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CS-227ENST00000551441 JCADQ9P266 1359 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-227ENST00000551441 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 TBX22Q9Y458 520 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 E9PCH4 1651 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 LRP6O75581 1613 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 UNC13BO14795 1591 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
CS-227ENST00000551441 ITGAEP38570 1179 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 ATF3P18847 181 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 TRIM52Q96A61 297 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.84■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 PTPRUQ92729 1446 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-227ENST00000551441 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 NUP155O75694 1391 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 DIP2AQ14689 1571 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 TRPM2O94759 1503 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 BRINP3Q76B58 766 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-227ENST00000551441 SHPRHQ149N8 1683 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 PIK3R4Q99570 1358 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 ROCK1Q13464 1354 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.72■■□□□ 1.55
CS-227ENST00000551441 RXRBP28702 533 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 METP08581 1390 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.68■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 AFF2P51816 1311 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 MST1RQ04912 1400 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-227ENST00000551441 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.63■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 C8orf37Q96NL8 207 aa24.63■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.62■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 DCCP43146 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.6■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.59■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 CLTCL1P53675 1640 aa24.59■■□□□ 1.53
CS-227ENST00000551441 ADAMTS2O95450 1211 aa24.57■■□□□ 1.52
CS-227ENST00000551441 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-227ENST00000551441 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-227ENST00000551441 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CS-227ENST00000551441 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.55■■□□□ 1.52
CS-227ENST00000551441 RGS12O14924 1447 aa24.52■■□□□ 1.52
CS-227ENST00000551441 KIF1BO60333 1816 aa24.51■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 NGLY1Q96IV0 654 aa24.51■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 ORAI2Q96SN7 254 aa24.51■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.5■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.47■■□□□ 1.51
CS-227ENST00000551441 NAIPQ13075 1403 aa24.42■■□□□ 1.5
CS-227ENST00000551441 USP21Q9UK80 565 aa24.41■■□□□ 1.5
CS-227ENST00000551441 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CS-227ENST00000551441 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CS-227ENST00000551441 PTCH1Q13635 1447 aa24.39■■□□□ 1.5
CS-227ENST00000551441 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 NUTM2FA1L443 756 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 LAMC1P11047 1609 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 PPLO60437 1756 aa24.34■■□□□ 1.49
CS-227ENST00000551441 STK26Q9P289 416 aa24.33■■□□□ 1.49
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