RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.2■■■■■ 4.19
BRF1-213ENST00000548421 MYOM2P54296 1465 aa41.19■■■■■ 4.18
BRF1-213ENST00000548421 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
BRF1-213ENST00000548421 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
BRF1-213ENST00000548421 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.14■■■■■ 4.18
BRF1-213ENST00000548421 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.11■■■■■ 4.17
BRF1-213ENST00000548421 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.07■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 ZFYVE9O95405 1425 aa41.05■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.05■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.04■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.03■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.02■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
BRF1-213ENST00000548421 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.01■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 SLIT1O75093 1534 aa41■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.97■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.97■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 PIK3C2GO75747 1445 aa40.97■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
BRF1-213ENST00000548421 LAMC1P11047 1609 aa40.88■■■■■ 4.14
BRF1-213ENST00000548421 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
BRF1-213ENST00000548421 EID1Q9Y6B2 187 aa40.85■■■■■ 4.13
BRF1-213ENST00000548421 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.82■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.81■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 LTKP29376 864 aa40.81■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.8■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.8■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.78■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.78■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 IQGAP1P46940 1657 aa40.78■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.77■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 CARD11Q9BXL7 1154 aa40.77■■■■■ 4.12
BRF1-213ENST00000548421 ALKQ9UM73 1620 aa40.75■■■■■ 4.11
BRF1-213ENST00000548421 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
BRF1-213ENST00000548421 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
BRF1-213ENST00000548421 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.72■■■■■ 4.11
BRF1-213ENST00000548421 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.71■■■■■ 4.11
BRF1-213ENST00000548421 ADGRB1O14514 1584 aa40.7■■■■■ 4.11
BRF1-213ENST00000548421 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
BRF1-213ENST00000548421 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
BRF1-213ENST00000548421 USP47Q96K76 1375 aa40.65■■■■■ 4.1
BRF1-213ENST00000548421 BCANQ96GW7 911 aa40.65■■■■■ 4.1
BRF1-213ENST00000548421 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.64■■■■■ 4.1
BRF1-213ENST00000548421 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.62■■■■■ 4.09
BRF1-213ENST00000548421 DIP2AQ14689 1571 aa40.61■■■■■ 4.09
BRF1-213ENST00000548421 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
BRF1-213ENST00000548421 MED14O60244 1454 aa40.58■■■■■ 4.09
BRF1-213ENST00000548421 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.58■■■■■ 4.09
BRF1-213ENST00000548421 HSPA2P54652 639 aa40.53■■■■■ 4.08
BRF1-213ENST00000548421 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
BRF1-213ENST00000548421 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
BRF1-213ENST00000548421 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.51■■■■■ 4.08
BRF1-213ENST00000548421 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 METP08581 1390 aa40.49■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.49■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 TBX22Q9Y458 520 aa40.49■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
BRF1-213ENST00000548421 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.44■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.44■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.43■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 STRCQ7RTU9 1775 aa40.43■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 STK26Q9P289 416 aa40.39■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 DLC1Q96QB1 1528 aa40.38■■■■■ 4.06
BRF1-213ENST00000548421 PIK3R4Q99570 1358 aa40.38■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 ABCC11Q96J66 1382 aa40.37■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 TECPR2O15040 1411 aa40.35■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 QRICH2Q9H0J4 1663 aa40.33■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 CPS1P31327 1500 aa40.33■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 PTPRUQ92729 1446 aa40.33■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
BRF1-213ENST00000548421 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
BRF1-213ENST00000548421 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
BRF1-213ENST00000548421 TESK2Q96S53 571 aa40.28■■■■■ 4.04
BRF1-213ENST00000548421 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.25■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.24■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 SIRT1Q96EB6 747 aa40.24■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.24■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 PRAM1Q96QH2 718 aa40.23■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 PTCH1Q13635 1447 aa40.22■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 POGKQ9P215 609 aa40.21■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 SLC24A1O60721 1099 aa40.2■■■■■ 4.03
BRF1-213ENST00000548421 NWD1Q149M9 1564 aa40.19■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.19■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 TMF1P82094 1093 aa40.16■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.15■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.14■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.13■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.13■■■■■ 4.02
BRF1-213ENST00000548421 KCNA6P17658 529 aa40.13■■■■■ 4.01
BRF1-213ENST00000548421 CCDC7Q96M83 1385 aa40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms