RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547752.5

PTPRR-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-206	ENST00000547752	SLIT1	O75093	1534 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	KIF1B	O60333	1816 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	ZFYVE9	O95405	1425 aa		14.05	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	LTK	P29376	864 aa		14.05	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	RGL3	Q3MIN7	710 aa		14.04	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		14.04	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		14.04	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		14.04	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	NEUROD1	Q13562	356 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		14.02	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		14.02	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		14.02	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.16
PTPRR-206	ENST00000547752	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	STRC	Q7RTU9	1775 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	MED14	O60244	1454 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	PPL	O60437	1756 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRR-206	ENST00000547752	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	MYOM2	P54296	1465 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRR-206	ENST00000547752	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	MET	P08581	1390 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PTPRR-206	ENST00000547752	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	KCNA6	P17658	529 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	ADGRB1	O14514	1584 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	LAMC1	P11047	1609 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRR-206	ENST00000547752	STK26	Q9P289	416 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	TECPR2	O15040	1411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	CPS1	P31327	1500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	DLC1	Q96QB1	1528 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRR-206	ENST00000547752	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRR-206	ENST00000547752	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22

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