RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	RNF40	O75150	1001 aa		10	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	WNT2B	Q93097	391 aa		10	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	LRCH3	Q96II8	777 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	SULF1	Q8IWU6	871 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	SLF2	Q8IX21	1173 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MDM2-231	ENST00000544125	RDH13	Q8NBN7	331 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	BCAM	P50895	628 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	MS4A1	P11836	297 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		9.93	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	PPP4C	P60510	307 aa		9.92	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		9.92	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	CD46	P15529	392 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	NECTIN2	Q92692	538 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	FAM117A	Q9C073	453 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	SLC10A3	P09131	477 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		9.9	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	9.9	□□□□□ -0.82
MDM2-231	ENST00000544125	CFH	P08603	1231 aa		9.87	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	PTPN5	P54829	565 aa		9.87	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	GCGR	P47871	477 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	WBP1L	Q9NX94	342 aa		9.86	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	PRR14	Q9BWN1	585 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MDM2-231	ENST00000544125	KDM4A	O75164	1064 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	APLP1	P51693	650 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	MMRN1	Q13201	1228 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	USP46	P62068	366 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	FUT2	Q10981	343 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	HCST	Q9UBK5	93 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	ATP6V1A	P38606	617 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MDM2-231	ENST00000544125	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	HOXA2	O43364	376 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFV2	P19404	249 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		9.75	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		9.74	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	9.73	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	FDX1	P10109	184 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	COPS2	P61201	443 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	GUCA2A	Q02747	115 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	MORN1	Q5T089	497 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	HLA-C	Q95604	372 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	GOPC	Q9HD26	462 aa		9.72	□□□□□ -0.85
MDM2-231	ENST00000544125	SPTLC1	O15269	473 aa		9.71	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	NR1I2	O75469	434 aa		9.71	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.71	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	GJA5	P36382	358 aa		9.7	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		9.7	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		9.7	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		9.69	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	MTR	Q99707	1265 aa		9.69	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125		Q3C1V9	767 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	IL21	Q9HBE4	155 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	C6orf229	H3BNL8	230 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
MDM2-231	ENST00000544125	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86

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