RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
COPS7A-216ENST00000543170 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
COPS7A-216ENST00000543170 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.16■■□□□ 1.94
COPS7A-216ENST00000543170 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.14■■□□□ 1.94
COPS7A-216ENST00000543170 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.14■■□□□ 1.94
COPS7A-216ENST00000543170 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.09■■□□□ 1.93
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
COPS7A-216ENST00000543170 DIP2AQ14689 1571 aa27.09■■□□□ 1.93
COPS7A-216ENST00000543170 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.08■■□□□ 1.93
COPS7A-216ENST00000543170 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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COPS7A-216ENST00000543170 CPS1P31327 1500 aa27.07■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.05■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.05■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.05■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 IFT172Q9UG01 1749 aa27.04■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.02■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.02■■□□□ 1.92
COPS7A-216ENST00000543170 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.01■■□□□ 1.91
COPS7A-216ENST00000543170 NWD1Q149M9 1564 aa27.01■■□□□ 1.91
COPS7A-216ENST00000543170 CERKQ8TCT0 537 aa27■■□□□ 1.91
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COPS7A-216ENST00000543170 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.96■■□□□ 1.91
COPS7A-216ENST00000543170 TBX22Q9Y458 520 aa26.96■■□□□ 1.91
COPS7A-216ENST00000543170 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 BCANQ96GW7 911 aa26.95■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 PIK3R4Q99570 1358 aa26.95■■□□□ 1.9
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COPS7A-216ENST00000543170 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 MYOM2P54296 1465 aa26.91■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 KCNA6P17658 529 aa26.9■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 RGL3Q3MIN7 710 aa26.89■■□□□ 1.9
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.89■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.87■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 ALKQ9UM73 1620 aa26.86■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 PIK3C2GO75747 1445 aa26.85■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
COPS7A-216ENST00000543170 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.82■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 LAMC1P11047 1609 aa26.81■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 FBXO41Q8TF61 875 aa26.81■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 PTPRUQ92729 1446 aa26.81■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 STAC3Q96MF2 364 aa26.8■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 METP08581 1390 aa26.8■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.79■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.77■■□□□ 1.88
COPS7A-216ENST00000543170 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.75■■□□□ 1.87
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM94Q12767 1356 aa26.74■■□□□ 1.87
COPS7A-216ENST00000543170 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.73■■□□□ 1.87
COPS7A-216ENST00000543170 PTCH1Q13635 1447 aa26.73■■□□□ 1.87
COPS7A-216ENST00000543170 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.72■■□□□ 1.87
COPS7A-216ENST00000543170 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
COPS7A-216ENST00000543170 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.7■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.7■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 TECPR2O15040 1411 aa26.66■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.65■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.65■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.64■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 TOM1O60784 492 aa26.64■■□□□ 1.86
COPS7A-216ENST00000543170 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 MSH6P52701 1360 aa26.63■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 ADGRB1O14514 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.62■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 ABCC11Q96J66 1382 aa26.6■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 DCCP43146 1447 aa26.6■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.6■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.59■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.59■■□□□ 1.85
COPS7A-216ENST00000543170 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.57■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 NEUROD1Q13562 356 aa26.57■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.57■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 DLC1Q96QB1 1528 aa26.56■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.56■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.55■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.55■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.54■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 C14orf37Q86TY3 774 aa26.52■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 SIRT1Q96EB6 747 aa26.52■■□□□ 1.84
COPS7A-216ENST00000543170 TONSLQ96HA7 1378 aa26.5■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.49■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.49■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.49■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 STK26Q9P289 416 aa26.48■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 PIP4K2BP78356 416 aa26.46■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
COPS7A-216ENST00000543170 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.45■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 ATF3P18847 181 aa26.45■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.43■■□□□ 1.82
COPS7A-216ENST00000543170 MST1RQ04912 1400 aa26.42■■□□□ 1.82
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