RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.07■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.07■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 CLTCL1P53675 1640 aa26.06■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 SLIT1O75093 1534 aa26.06■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 CPS1P31327 1500 aa26.06■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.05■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 EID1Q9Y6B2 187 aa26.02■■□□□ 1.76
LATS1-205ENST00000542720 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 ALKQ9UM73 1620 aa26■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 MED14O60244 1454 aa25.99■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.99■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 ZFYVE9O95405 1425 aa25.97■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
LATS1-205ENST00000542720 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.95■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 KIF1BO60333 1816 aa25.94■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.93■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 IQGAP1P46940 1657 aa25.93■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.91■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 RGL3Q3MIN7 710 aa25.89■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 BCANQ96GW7 911 aa25.89■■□□□ 1.74
LATS1-205ENST00000542720 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.88■■□□□ 1.73
LATS1-205ENST00000542720 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LATS1-205ENST00000542720 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.86■■□□□ 1.73
LATS1-205ENST00000542720 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.85■■□□□ 1.73
LATS1-205ENST00000542720 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.84■■□□□ 1.73
LATS1-205ENST00000542720 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.81■■□□□ 1.72
LATS1-205ENST00000542720 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.81■■□□□ 1.72
LATS1-205ENST00000542720 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
LATS1-205ENST00000542720 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.78■■□□□ 1.72
LATS1-205ENST00000542720 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 PPLO60437 1756 aa25.75■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 TBX22Q9Y458 520 aa25.75■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.74■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.73■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.73■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.72■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.7■■□□□ 1.71
LATS1-205ENST00000542720 IFT172Q9UG01 1749 aa25.69■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 KCNA6P17658 529 aa25.69■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 POTEAQ6S8J7 498 aa25.66■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 NEUROD1Q13562 356 aa25.65■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.65■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 METP08581 1390 aa25.65■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 DIP2AQ14689 1571 aa25.65■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.64■■□□□ 1.7
LATS1-205ENST00000542720 PTPRUQ92729 1446 aa25.63■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.61■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 PIK3R4Q99570 1358 aa25.6■■□□□ 1.69
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LATS1-205ENST00000542720 PIK3C2GO75747 1445 aa25.58■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.58■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 MYOM2P54296 1465 aa25.58■■□□□ 1.69
LATS1-205ENST00000542720 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.57■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.56■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.55■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 TMEM94Q12767 1356 aa25.55■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.54■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
LATS1-205ENST00000542720 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
LATS1-205ENST00000542720 STAC3Q96MF2 364 aa25.5■■□□□ 1.67
LATS1-205ENST00000542720 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.48■■□□□ 1.67
LATS1-205ENST00000542720 STK26Q9P289 416 aa25.48■■□□□ 1.67
LATS1-205ENST00000542720 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.44■■□□□ 1.66
LATS1-205ENST00000542720 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LATS1-205ENST00000542720 C14orf37Q86TY3 774 aa25.42■■□□□ 1.66
LATS1-205ENST00000542720 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
LATS1-205ENST00000542720 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.4■■□□□ 1.66
LATS1-205ENST00000542720 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
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LATS1-205ENST00000542720 ABCC11Q96J66 1382 aa25.39■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.38■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.38■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 MSH6P52701 1360 aa25.38■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 TONSLQ96HA7 1378 aa25.38■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 PTCH1Q13635 1447 aa25.37■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 ADGRB1O14514 1584 aa25.37■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.37■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.36■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.35■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 TECPR2O15040 1411 aa25.35■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.34■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.34■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.34■■□□□ 1.65
LATS1-205ENST00000542720 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.33■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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