RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540963.1

CHFR-218, Transcript of checkpoint with forkhead and ring finger domains, humanhuman

TSL 2

Gene CHFR, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFR-218ENST00000540963 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.71■■■■■ 4.27
CHFR-218ENST00000540963 ZFYVE9O95405 1425 aa41.69■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 MSH6P52701 1360 aa41.68■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.67■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.65■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 BCANQ96GW7 911 aa41.64■■■■■ 4.26
CHFR-218ENST00000540963 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.62■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.62■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 SLAIN2Q9P270 581 aa41.59■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.59■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.58■■■■■ 4.25
CHFR-218ENST00000540963 PHLPP1O60346 1717 aa41.55■■■■■ 4.24
CHFR-218ENST00000540963 UNC13BO14795 1591 aa41.55■■■■■ 4.24
CHFR-218ENST00000540963 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
CHFR-218ENST00000540963 POTEAQ6S8J7 498 aa41.54■■■■■ 4.24
CHFR-218ENST00000540963 TBX22Q9Y458 520 aa41.54■■■■■ 4.24
CHFR-218ENST00000540963 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.24
CHFR-218ENST00000540963 JCADQ9P266 1359 aa41.5■■■■■ 4.23
CHFR-218ENST00000540963 DIP2AQ14689 1571 aa41.46■■■■■ 4.23
CHFR-218ENST00000540963 PIK3R4Q99570 1358 aa41.45■■■■■ 4.23
CHFR-218ENST00000540963 E9PCH4 1651 aa41.45■■■■■ 4.23
CHFR-218ENST00000540963 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
CHFR-218ENST00000540963 ROCK1Q13464 1354 aa41.41■■■■■ 4.22
CHFR-218ENST00000540963 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.41■■■■■ 4.22
CHFR-218ENST00000540963 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.4■■■■■ 4.22
CHFR-218ENST00000540963 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
CHFR-218ENST00000540963 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.35■■■■■ 4.21
CHFR-218ENST00000540963 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.34■■■■■ 4.21
CHFR-218ENST00000540963 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
CHFR-218ENST00000540963 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa41.33■■■■■ 4.21
CHFR-218ENST00000540963 C14orf37Q86TY3 774 aa41.32■■■■■ 4.21
CHFR-218ENST00000540963 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CHFR-218ENST00000540963 TRPM2O94759 1503 aa41.29■■■■■ 4.2
CHFR-218ENST00000540963 ATF3P18847 181 aa41.27■■■■■ 4.2
CHFR-218ENST00000540963 SHPRHQ149N8 1683 aa41.24■■■■■ 4.19
CHFR-218ENST00000540963 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
CHFR-218ENST00000540963 NUP155O75694 1391 aa41.22■■■■■ 4.19
CHFR-218ENST00000540963 LRP6O75581 1613 aa41.2■■■■■ 4.19
CHFR-218ENST00000540963 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
CHFR-218ENST00000540963 DCCP43146 1447 aa41.19■■■■■ 4.18
CHFR-218ENST00000540963 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.19■■■■■ 4.18
CHFR-218ENST00000540963 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
CHFR-218ENST00000540963 PTPRUQ92729 1446 aa41.16■■■■■ 4.18
CHFR-218ENST00000540963 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.13■■■■■ 4.18
CHFR-218ENST00000540963 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
CHFR-218ENST00000540963 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
CHFR-218ENST00000540963 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.11■■■■■ 4.17
CHFR-218ENST00000540963 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.1■■■■■ 4.17
CHFR-218ENST00000540963 BRINP3Q76B58 766 aa41.1■■■■■ 4.17
CHFR-218ENST00000540963 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.03■■■■■ 4.16
CHFR-218ENST00000540963 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.01■■■■■ 4.15
CHFR-218ENST00000540963 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.99■■■■■ 4.15
CHFR-218ENST00000540963 MST1RQ04912 1400 aa40.99■■■■■ 4.15
CHFR-218ENST00000540963 ITGAEP38570 1179 aa40.95■■■■■ 4.15
CHFR-218ENST00000540963 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
CHFR-218ENST00000540963 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 METP08581 1390 aa40.93■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 RXRBP28702 533 aa40.92■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.91■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 TRIM52Q96A61 297 aa40.9■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.88■■■■■ 4.14
CHFR-218ENST00000540963 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 CLTCL1P53675 1640 aa40.85■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 KIF1BO60333 1816 aa40.83■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.83■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 AFF2P51816 1311 aa40.82■■■■■ 4.13
CHFR-218ENST00000540963 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.76■■■■■ 4.12
CHFR-218ENST00000540963 LAMC1P11047 1609 aa40.75■■■■■ 4.11
CHFR-218ENST00000540963 PTCH1Q13635 1447 aa40.74■■■■■ 4.11
CHFR-218ENST00000540963 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.71■■■■■ 4.11
CHFR-218ENST00000540963 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.7■■■■■ 4.11
CHFR-218ENST00000540963 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CHFR-218ENST00000540963 NAIPQ13075 1403 aa40.67■■■■■ 4.1
CHFR-218ENST00000540963 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CHFR-218ENST00000540963 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CHFR-218ENST00000540963 C8orf37Q96NL8 207 aa40.67■■■■■ 4.1
CHFR-218ENST00000540963 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
CHFR-218ENST00000540963 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
CHFR-218ENST00000540963 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.63■■■■■ 4.09
CHFR-218ENST00000540963 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
CHFR-218ENST00000540963 RGS12O14924 1447 aa40.61■■■■■ 4.09
CHFR-218ENST00000540963 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
CHFR-218ENST00000540963 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.6■■■■■ 4.09
CHFR-218ENST00000540963 HFM1A2PYH4 1435 aa40.57■■■■■ 4.08
CHFR-218ENST00000540963 NGLY1Q96IV0 654 aa40.56■■■■■ 4.08
CHFR-218ENST00000540963 PPLO60437 1756 aa40.53■■■■■ 4.08
CHFR-218ENST00000540963 ORAI2Q96SN7 254 aa40.52■■■■■ 4.08
CHFR-218ENST00000540963 ADAMTS2O95450 1211 aa40.5■■■■■ 4.07
CHFR-218ENST00000540963 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CHFR-218ENST00000540963 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
CHFR-218ENST00000540963 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.44■■■■■ 4.06
CHFR-218ENST00000540963 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
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