RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
GOLGA3-204ENST00000534967 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
GOLGA3-204ENST00000534967 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.01■■■■■ 4.15
GOLGA3-204ENST00000534967 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
GOLGA3-204ENST00000534967 ZFYVE9O95405 1425 aa40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3-204ENST00000534967 MSH6P52701 1360 aa40.95■■■■■ 4.15
GOLGA3-204ENST00000534967 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.94■■■■■ 4.14
GOLGA3-204ENST00000534967 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.92■■■■■ 4.14
GOLGA3-204ENST00000534967 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.92■■■■■ 4.14
GOLGA3-204ENST00000534967 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.91■■■■■ 4.14
GOLGA3-204ENST00000534967 POTEAQ6S8J7 498 aa40.91■■■■■ 4.14
GOLGA3-204ENST00000534967 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
GOLGA3-204ENST00000534967 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.87■■■■■ 4.13
GOLGA3-204ENST00000534967 SLAIN2Q9P270 581 aa40.87■■■■■ 4.13
GOLGA3-204ENST00000534967 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
GOLGA3-204ENST00000534967 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
GOLGA3-204ENST00000534967 PHLPP1O60346 1717 aa40.82■■■■■ 4.13
GOLGA3-204ENST00000534967 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
GOLGA3-204ENST00000534967 UNC13BO14795 1591 aa40.8■■■■■ 4.12
GOLGA3-204ENST00000534967 TBX22Q9Y458 520 aa40.78■■■■■ 4.12
GOLGA3-204ENST00000534967 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
GOLGA3-204ENST00000534967 JCADQ9P266 1359 aa40.74■■■■■ 4.11
GOLGA3-204ENST00000534967 E9PCH4 1651 aa40.73■■■■■ 4.11
GOLGA3-204ENST00000534967 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.71■■■■■ 4.11
GOLGA3-204ENST00000534967 C14orf37Q86TY3 774 aa40.7■■■■■ 4.11
GOLGA3-204ENST00000534967 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.69■■■■■ 4.1
GOLGA3-204ENST00000534967 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
GOLGA3-204ENST00000534967 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3-204ENST00000534967 DIP2AQ14689 1571 aa40.64■■■■■ 4.1
GOLGA3-204ENST00000534967 ROCK1Q13464 1354 aa40.63■■■■■ 4.1
GOLGA3-204ENST00000534967 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
GOLGA3-204ENST00000534967 PIK3R4Q99570 1358 aa40.6■■■■■ 4.09
GOLGA3-204ENST00000534967 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
GOLGA3-204ENST00000534967 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.58■■■■■ 4.09
GOLGA3-204ENST00000534967 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.58■■■■■ 4.09
GOLGA3-204ENST00000534967 ATF3P18847 181 aa40.57■■■■■ 4.09
GOLGA3-204ENST00000534967 NUP155O75694 1391 aa40.57■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 LRP6O75581 1613 aa40.56■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 TRPM2O94759 1503 aa40.54■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.53■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPRUQ92729 1446 aa40.52■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.52■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 ITGAEP38570 1179 aa40.51■■■■■ 4.08
GOLGA3-204ENST00000534967 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
GOLGA3-204ENST00000534967 SHPRHQ149N8 1683 aa40.44■■■■■ 4.06
GOLGA3-204ENST00000534967 BRINP3Q76B58 766 aa40.43■■■■■ 4.06
GOLGA3-204ENST00000534967 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.41■■■■■ 4.06
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
GOLGA3-204ENST00000534967 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 DCCP43146 1447 aa40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.36■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 TRIM52Q96A61 297 aa40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.32■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
GOLGA3-204ENST00000534967 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
GOLGA3-204ENST00000534967 METP08581 1390 aa40.3■■■■■ 4.04
GOLGA3-204ENST00000534967 MST1RQ04912 1400 aa40.29■■■■■ 4.04
GOLGA3-204ENST00000534967 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3-204ENST00000534967 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3-204ENST00000534967 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.22■■■■■ 4.03
GOLGA3-204ENST00000534967 RXRBP28702 533 aa40.21■■■■■ 4.03
GOLGA3-204ENST00000534967 CLTCL1P53675 1640 aa40.2■■■■■ 4.03
GOLGA3-204ENST00000534967 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
GOLGA3-204ENST00000534967 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.18■■■■■ 4.02
GOLGA3-204ENST00000534967 AFF2P51816 1311 aa40.17■■■■■ 4.02
GOLGA3-204ENST00000534967 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
GOLGA3-204ENST00000534967 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
GOLGA3-204ENST00000534967 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.13■■■■■ 4.02
GOLGA3-204ENST00000534967 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
GOLGA3-204ENST00000534967 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.09■■■■■ 4.01
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF1BO60333 1816 aa40.07■■■■■ 4
GOLGA3-204ENST00000534967 C8orf37Q96NL8 207 aa40.06■■■■■ 4
GOLGA3-204ENST00000534967 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.02■■■■■ 4
GOLGA3-204ENST00000534967 NAIPQ13075 1403 aa40.01■■■■■ 4
GOLGA3-204ENST00000534967 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
GOLGA3-204ENST00000534967 PTCH1Q13635 1447 aa39.98■■■■□ 3.99
GOLGA3-204ENST00000534967 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.97■■■■□ 3.99
GOLGA3-204ENST00000534967 RGS12O14924 1447 aa39.95■■■■□ 3.99
GOLGA3-204ENST00000534967 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
GOLGA3-204ENST00000534967 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
GOLGA3-204ENST00000534967 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
GOLGA3-204ENST00000534967 ADAMTS2O95450 1211 aa39.93■■■■□ 3.98
GOLGA3-204ENST00000534967 ORAI2Q96SN7 254 aa39.93■■■■□ 3.98
GOLGA3-204ENST00000534967 LAMC1P11047 1609 aa39.91■■■■□ 3.98
GOLGA3-204ENST00000534967 NGLY1Q96IV0 654 aa39.9■■■■□ 3.98
GOLGA3-204ENST00000534967 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
GOLGA3-204ENST00000534967 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.85■■■■□ 3.97
GOLGA3-204ENST00000534967 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.85■■■■□ 3.97
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3-204ENST00000534967 HFM1A2PYH4 1435 aa39.81■■■■□ 3.96
GOLGA3-204ENST00000534967 PPLO60437 1756 aa39.8■■■■□ 3.96
GOLGA3-204ENST00000534967 USP21Q9UK80 565 aa39.77■■■■□ 3.96
GOLGA3-204ENST00000534967 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
GOLGA3-204ENST00000534967 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms