RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, human

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GOLGA3-204	ENST00000534967	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
GOLGA3-204	ENST00000534967	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
GOLGA3-204	ENST00000534967	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.01	■■■■■ 4.15
GOLGA3-204	ENST00000534967	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZFYVE9	O95405	1425 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GOLGA3-204	ENST00000534967	MSH6	P52701	1360 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		40.94	■■■■■ 4.14
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GOLGA3-204	ENST00000534967	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GOLGA3-204	ENST00000534967	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GOLGA3-204	ENST00000534967	POTEA	Q6S8J7	498 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
GOLGA3-204	ENST00000534967	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLAIN2	Q9P270	581 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GOLGA3-204	ENST00000534967	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
GOLGA3-204	ENST00000534967	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
GOLGA3-204	ENST00000534967	PHLPP1	O60346	1717 aa		40.82	■■■■■ 4.13
GOLGA3-204	ENST00000534967	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
GOLGA3-204	ENST00000534967	UNC13B	O14795	1591 aa		40.8	■■■■■ 4.12
GOLGA3-204	ENST00000534967	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.78	■■■■■ 4.12
GOLGA3-204	ENST00000534967	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
GOLGA3-204	ENST00000534967	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.75	■■■■■ 4.11
GOLGA3-204	ENST00000534967	JCAD	Q9P266	1359 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GOLGA3-204	ENST00000534967		E9PCH4	1651 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GOLGA3-204	ENST00000534967	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.71	■■■■■ 4.11
GOLGA3-204	ENST00000534967	C14orf37	Q86TY3	774 aa		40.7	■■■■■ 4.11
GOLGA3-204	ENST00000534967	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		40.69	■■■■■ 4.1
GOLGA3-204	ENST00000534967	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GOLGA3-204	ENST00000534967	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.64	■■■■■ 4.1
GOLGA3-204	ENST00000534967	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.64	■■■■■ 4.1
GOLGA3-204	ENST00000534967	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.63	■■■■■ 4.1
GOLGA3-204	ENST00000534967	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
GOLGA3-204	ENST00000534967	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GOLGA3-204	ENST00000534967	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
GOLGA3-204	ENST00000534967	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GOLGA3-204	ENST00000534967	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GOLGA3-204	ENST00000534967	ATF3	P18847	181 aa		40.57	■■■■■ 4.09
GOLGA3-204	ENST00000534967	NUP155	O75694	1391 aa		40.57	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	LRP6	O75581	1613 aa		40.56	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRPM2	O94759	1503 aa		40.54	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	PTPRU	Q92729	1446 aa		40.52	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.52	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	ITGAE	P38570	1179 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GOLGA3-204	ENST00000534967	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
GOLGA3-204	ENST00000534967	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.44	■■■■■ 4.06
GOLGA3-204	ENST00000534967	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GOLGA3-204	ENST00000534967	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.41	■■■■■ 4.06
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
GOLGA3-204	ENST00000534967	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	DCC	P43146	1447 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.33	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		40.32	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
GOLGA3-204	ENST00000534967	MET	P08581	1390 aa		40.3	■■■■■ 4.04
GOLGA3-204	ENST00000534967	MST1R	Q04912	1400 aa		40.29	■■■■■ 4.04
GOLGA3-204	ENST00000534967	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	40.23	■■■■■ 4.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	RXRB	P28702	533 aa		40.21	■■■■■ 4.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.2	■■■■■ 4.03
GOLGA3-204	ENST00000534967	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.19	■■■■■ 4.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	AFF2	P51816	1311 aa		40.17	■■■■■ 4.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		40.13	■■■■■ 4.02
GOLGA3-204	ENST00000534967	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.09	■■■■■ 4.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIF1B	O60333	1816 aa		40.07	■■■■■ 4
GOLGA3-204	ENST00000534967	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.06	■■■■■ 4
GOLGA3-204	ENST00000534967	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		40.02	■■■■■ 4
GOLGA3-204	ENST00000534967	NAIP	Q13075	1403 aa		40.01	■■■■■ 4
GOLGA3-204	ENST00000534967	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	PTCH1	Q13635	1447 aa		39.98	■■■■□ 3.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	RGS12	O14924	1447 aa		39.95	■■■■□ 3.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	39.95	■■■■□ 3.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	39.95	■■■■□ 3.99
GOLGA3-204	ENST00000534967	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	39.94	■■■■□ 3.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	ADAMTS2	O95450	1211 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	ORAI2	Q96SN7	254 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	LAMC1	P11047	1609 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	NGLY1	Q96IV0	654 aa		39.9	■■■■□ 3.98
GOLGA3-204	ENST00000534967	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	39.88	■■■■□ 3.97
GOLGA3-204	ENST00000534967	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		39.85	■■■■□ 3.97
GOLGA3-204	ENST00000534967	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		39.85	■■■■□ 3.97
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	39.81	■■■■□ 3.96
GOLGA3-204	ENST00000534967	HFM1	A2PYH4	1435 aa		39.81	■■■■□ 3.96
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPL	O60437	1756 aa		39.8	■■■■□ 3.96
GOLGA3-204	ENST00000534967	USP21	Q9UK80	565 aa		39.77	■■■■□ 3.96
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	39.71	■■■■□ 3.95
GOLGA3-204	ENST00000534967	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	39.7	■■■■□ 3.95

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