RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 TRPM2O94759 1503 aa24.95■■□□□ 1.58
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PKP3-209ENST00000533069 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.91■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 BCANQ96GW7 911 aa24.91■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.91■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.91■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 TOM1O60784 492 aa24.9■■□□□ 1.58
PKP3-209ENST00000533069 KCNA6P17658 529 aa24.88■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 CLTCL1P53675 1640 aa24.86■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 NWD1Q149M9 1564 aa24.84■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 TBX22Q9Y458 520 aa24.84■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.84■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 DIP2AQ14689 1571 aa24.84■■□□□ 1.57
PKP3-209ENST00000533069 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PKP3-209ENST00000533069 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PKP3-209ENST00000533069 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.81■■□□□ 1.56
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PKP3-209ENST00000533069 PIK3R4Q99570 1358 aa24.79■■□□□ 1.56
PKP3-209ENST00000533069 PIP4K2BP78356 416 aa24.78■■□□□ 1.56
PKP3-209ENST00000533069 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.78■■□□□ 1.56
PKP3-209ENST00000533069 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PKP3-209ENST00000533069 ALKQ9UM73 1620 aa24.77■■□□□ 1.56
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PKP3-209ENST00000533069 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.76■■□□□ 1.55
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PKP3-209ENST00000533069 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.73■■□□□ 1.55
PKP3-209ENST00000533069 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.73■■□□□ 1.55
PKP3-209ENST00000533069 FOXD1Q16676 465 aa24.73■■□□□ 1.55
PKP3-209ENST00000533069 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.72■■□□□ 1.55
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PKP3-209ENST00000533069 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PKP3-209ENST00000533069 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.69■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.69■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 HSPA1LP34931 641 aa24.67■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 MSH6P52701 1360 aa24.67■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 HRCP23327 699 aa24.64■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.64■■□□□ 1.54
PKP3-209ENST00000533069 PTPRUQ92729 1446 aa24.63■■□□□ 1.53
PKP3-209ENST00000533069 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.62■■□□□ 1.53
PKP3-209ENST00000533069 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.61■■□□□ 1.53
PKP3-209ENST00000533069 METP08581 1390 aa24.61■■□□□ 1.53
PKP3-209ENST00000533069 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PKP3-209ENST00000533069 C14orf37Q86TY3 774 aa24.58■■□□□ 1.53
PKP3-209ENST00000533069 PPLO60437 1756 aa24.57■■□□□ 1.52
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.57■■□□□ 1.52
PKP3-209ENST00000533069 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.55■■□□□ 1.52
PKP3-209ENST00000533069 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.54■■□□□ 1.52
PKP3-209ENST00000533069 RGL3Q3MIN7 710 aa24.54■■□□□ 1.52
PKP3-209ENST00000533069 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.53■■□□□ 1.52
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PKP3-209ENST00000533069 DCCP43146 1447 aa24.52■■□□□ 1.52
PKP3-209ENST00000533069 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.52■■□□□ 1.52
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PKP3-209ENST00000533069 PTCH1Q13635 1447 aa24.51■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.5■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.49■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 IFT172Q9UG01 1749 aa24.48■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 PIK3C2GO75747 1445 aa24.46■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.46■■□□□ 1.51
PKP3-209ENST00000533069 MYOM2P54296 1465 aa24.45■■□□□ 1.5
PKP3-209ENST00000533069 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.42■■□□□ 1.5
PKP3-209ENST00000533069 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PKP3-209ENST00000533069 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.41■■□□□ 1.5
PKP3-209ENST00000533069 TECPR2O15040 1411 aa24.38■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 MST1RQ04912 1400 aa24.37■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.36■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.35■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 LAMC1P11047 1609 aa24.35■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 ABCC11Q96J66 1382 aa24.34■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 BRINP3Q76B58 766 aa24.34■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
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PKP3-209ENST00000533069 STAC3Q96MF2 364 aa24.33■■□□□ 1.49
PKP3-209ENST00000533069 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 STK26Q9P289 416 aa24.31■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 JCADQ9P266 1359 aa24.3■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.3■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.28■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.27■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.27■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 SIRT1Q96EB6 747 aa24.27■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.27■■□□□ 1.48
PKP3-209ENST00000533069 ILDR2Q71H61 639 aa24.26■■□□□ 1.47
PKP3-209ENST00000533069 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.23■■□□□ 1.47
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