RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533013.1

TENM4-208, Transcript of teneurin transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene TENM4, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TENM4-208ENST00000533013 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.1■■□□□ 1.61
TENM4-208ENST00000533013 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TENM4-208ENST00000533013 KCNA6P17658 529 aa25.09■■□□□ 1.61
TENM4-208ENST00000533013 TMEM94Q12767 1356 aa25.08■■□□□ 1.61
TENM4-208ENST00000533013 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.07■■□□□ 1.6
TENM4-208ENST00000533013 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.07■■□□□ 1.6
TENM4-208ENST00000533013 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TENM4-208ENST00000533013 NUP155O75694 1391 aa25.03■■□□□ 1.6
TENM4-208ENST00000533013 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.02■■□□□ 1.6
TENM4-208ENST00000533013 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 ITGAEP38570 1179 aa25■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.97■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 DIP2AQ14689 1571 aa24.96■■□□□ 1.59
TENM4-208ENST00000533013 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.95■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 BCANQ96GW7 911 aa24.95■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 TBX22Q9Y458 520 aa24.94■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.94■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 MSH6P52701 1360 aa24.9■■□□□ 1.58
TENM4-208ENST00000533013 NAIPQ13075 1403 aa24.88■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.88■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 PIK3R4Q99570 1358 aa24.88■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.87■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 TRPM2O94759 1503 aa24.86■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.84■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 CLTCL1P53675 1640 aa24.83■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 PTPRUQ92729 1446 aa24.83■■□□□ 1.57
TENM4-208ENST00000533013 SLAIN2Q9P270 581 aa24.82■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 HFM1A2PYH4 1435 aa24.79■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.79■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 PHLPP1O60346 1717 aa24.78■■□□□ 1.56
TENM4-208ENST00000533013 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.75■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.73■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 DCCP43146 1447 aa24.71■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 METP08581 1390 aa24.71■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 KIF1BO60333 1816 aa24.7■■□□□ 1.55
TENM4-208ENST00000533013 C14orf37Q86TY3 774 aa24.7■■□□□ 1.54
TENM4-208ENST00000533013 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.7■■□□□ 1.54
TENM4-208ENST00000533013 JCADQ9P266 1359 aa24.69■■□□□ 1.54
TENM4-208ENST00000533013 ATF3P18847 181 aa24.66■■□□□ 1.54
TENM4-208ENST00000533013 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TENM4-208ENST00000533013 MST1RQ04912 1400 aa24.62■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 POTEAQ6S8J7 498 aa24.62■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 TRIM52Q96A61 297 aa24.62■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 SHPRHQ149N8 1683 aa24.62■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.61■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 LRP6O75581 1613 aa24.61■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.61■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 BRINP3Q76B58 766 aa24.61■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.59■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 PPLO60437 1756 aa24.58■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 PTCH1Q13635 1447 aa24.58■■□□□ 1.53
TENM4-208ENST00000533013 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.58■■□□□ 1.52
TENM4-208ENST00000533013 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.57■■□□□ 1.52
TENM4-208ENST00000533013 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.56■■□□□ 1.52
TENM4-208ENST00000533013 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TENM4-208ENST00000533013 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.52■■□□□ 1.52
TENM4-208ENST00000533013 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.52■■□□□ 1.52
TENM4-208ENST00000533013 FOXD1Q16676 465 aa24.51■■□□□ 1.51
TENM4-208ENST00000533013 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
TENM4-208ENST00000533013 LAMC1P11047 1609 aa24.47■■□□□ 1.51
TENM4-208ENST00000533013 IFT172Q9UG01 1749 aa24.47■■□□□ 1.51
TENM4-208ENST00000533013 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.46■■□□□ 1.51
TENM4-208ENST00000533013 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.46■■□□□ 1.51
TENM4-208ENST00000533013 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.43■■□□□ 1.5
TENM4-208ENST00000533013 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.41■■□□□ 1.5
TENM4-208ENST00000533013 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TENM4-208ENST00000533013 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TENM4-208ENST00000533013 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.4■■□□□ 1.5
TENM4-208ENST00000533013 TECPR2O15040 1411 aa24.39■■□□□ 1.5
TENM4-208ENST00000533013 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.39■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.38■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 PIK3C2GO75747 1445 aa24.37■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.35■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 RGL3Q3MIN7 710 aa24.34■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 ORAI2Q96SN7 254 aa24.34■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TENM4-208ENST00000533013 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms